論文の概要: Anatomically Constrained Transformers for Cardiac Amyloidosis Classification
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2509.19691v1
- Date: Wed, 24 Sep 2025 02:00:34 GMT
- ステータス: 翻訳完了
- システム内更新日: 2025-09-25 20:53:19.66077
- Title: Anatomically Constrained Transformers for Cardiac Amyloidosis Classification
- Title(参考訳): 心臓アミロイドーシス分類のための解剖学的拘束型トランスフォーマー
- Authors: Alexander Thorley, Agis Chartsias, Jordan Strom, Roberto Lang, Jeremy Slivnick, Jamie O'Driscoll, Rajan Sharma, Dipak Kotecha, Jinming Duan, Alberto Gomez,
- Abstract要約: 心アミロイドーシス (CA) は稀な心筋症であり, 心エコー図による臨床像の異常が特徴である。
CAを検出する別のアプローチは、畳み込みニューラルネットワークのようなビデオ分類モデルを使用して、ニューラルネットワークを経由する。
我々の解剖学的制約は、一般的な自己教師型学習マスク付きオートエンコーダの事前学習にも適用可能であることを示す。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 34.67313275621695
- License: http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/
- Abstract: Cardiac amyloidosis (CA) is a rare cardiomyopathy, with typical abnormalities in clinical measurements from echocardiograms such as reduced global longitudinal strain of the myocardium. An alternative approach for detecting CA is via neural networks, using video classification models such as convolutional neural networks. These models process entire video clips, but provide no assurance that classification is based on clinically relevant features known to be associated with CA. An alternative paradigm for disease classification is to apply models to quantitative features such as strain, ensuring that the classification relates to clinically relevant features. Drawing inspiration from this approach, we explicitly constrain a transformer model to the anatomical region where many known CA abnormalities occur -- the myocardium, which we embed as a set of deforming points and corresponding sampled image patches into input tokens. We show that our anatomical constraint can also be applied to the popular self-supervised learning masked autoencoder pre-training, where we propose to mask and reconstruct only anatomical patches. We show that by constraining both the transformer and pre-training task to the myocardium where CA imaging features are localized, we achieve increased performance on a CA classification task compared to full video transformers. Our model provides an explicit guarantee that the classification is focused on only anatomical regions of the echo, and enables us to visualize transformer attention scores over the deforming myocardium.
- Abstract(参考訳): 心アミロイドーシス (CA) は稀な心筋症であり, 心エコー図による心筋の経時的変化の減少などの臨床像に特徴的な異常がある。
CAを検出する別のアプローチは、畳み込みニューラルネットワークのようなビデオ分類モデルを使用して、ニューラルネットワークを経由する。
これらのモデルはビデオクリップ全体を処理しますが、分類がCAに関連することが知られている臨床的に関連性のある特徴に基づいていることを保証しません。
疾患分類の別のパラダイムは、その分類が臨床的に関連のある特徴に関係していることを保証するために、ひずみなどの定量的特徴にモデルを適用することである。
このアプローチからインスピレーションを得て、変圧器モデルを多くの既知のCA異常が発生している解剖学的領域(心筋)に明示的に拘束します。
我々の解剖学的制約は、一般的な自己教師型学習マスク付きオートエンコーダの事前訓練にも適用可能であることを示し、そこでは、解剖学的パッチのみをマスクし再構成することを提案する。
本研究では,CA画像の特徴が局所化されている心筋にトランスフォーマーとプレトレーニングタスクの両方を限定することにより,フルビデオトランスに比べてCA分類タスクの性能が向上することを示す。
我々のモデルは、エコーの解剖学的領域のみに焦点が当てられていることを明確に保証し、変形性心筋に対するトランスフォーマーの注意スコアを可視化することができる。
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