論文の概要: Anatomically Constrained Transformers for Echocardiogram Analysis
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2511.01109v1
- Date: Sun, 02 Nov 2025 22:52:30 GMT
- ステータス: 翻訳完了
- システム内更新日: 2025-11-05 16:37:27.06917
- Title: Anatomically Constrained Transformers for Echocardiogram Analysis
- Title(参考訳): 超音波心電図解析のための解剖学的拘束型変圧器
- Authors: Alexander Thorley, Agis Chartsias, Jordan Strom, Jeremy Slivnick, Dipak Kotecha, Alberto Gomez, Jinming Duan,
- Abstract要約: ViACTは変形解剖学的構造を点集合として表現し、その空間幾何学と対応する画像パッチの両方をトランスフォーマートークンにエンコードする。
事前トレーニング中、ViACTは、解剖学的パッチのみをマスクし再構成するマスク付き自動エンコーディング戦略に従っている。
ViACTは、タスク固有のコンポーネントを必要とせずに、心筋ポイントトラッキングに一般化する。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 38.280536446335056
- License: http://arxiv.org/licenses/nonexclusive-distrib/1.0/
- Abstract: Video transformers have recently demonstrated strong potential for echocardiogram (echo) analysis, leveraging self-supervised pre-training and flexible adaptation across diverse tasks. However, like other models operating on videos, they are prone to learning spurious correlations from non-diagnostic regions such as image backgrounds. To overcome this limitation, we propose the Video Anatomically Constrained Transformer (ViACT), a novel framework that integrates anatomical priors directly into the transformer architecture. ViACT represents a deforming anatomical structure as a point set and encodes both its spatial geometry and corresponding image patches into transformer tokens. During pre-training, ViACT follows a masked autoencoding strategy that masks and reconstructs only anatomical patches, enforcing that representation learning is focused on the anatomical region. The pre-trained model can then be fine-tuned for tasks localized to this region. In this work we focus on the myocardium, demonstrating the framework on echo analysis tasks such as left ventricular ejection fraction (EF) regression and cardiac amyloidosis (CA) detection. The anatomical constraint focuses transformer attention within the myocardium, yielding interpretable attention maps aligned with regions of known CA pathology. Moreover, ViACT generalizes to myocardium point tracking without requiring task-specific components such as correlation volumes used in specialized tracking networks.
- Abstract(参考訳): ビデオトランスフォーマーは、心エコー(echo)解析の強力な可能性を示し、様々なタスクにまたがる自己教師付き事前トレーニングと柔軟な適応を活用している。
しかし、ビデオで動く他のモデルと同様に、画像背景のような非診断領域から急激な相関を学習する傾向にある。
この制限を克服するために,ビデオ解剖学的制約付きトランスフォーマー (ViACT) を提案する。
ViACTは変形解剖学的構造を点集合として表現し、その空間幾何学と対応する画像パッチの両方をトランスフォーマートークンにエンコードする。
事前トレーニング中、ViACTは、解剖学的パッチのみをマスクし、再構成するマスク付き自己コード戦略に従い、表現学習は解剖学的領域に焦点を当てていることを強制する。
事前訓練されたモデルは、この領域にローカライズされたタスクのために微調整することができる。
本研究は心筋に焦点をあて,左室放出率(EF)回帰や心アミロイドーシス(CA)検出などのエコー解析の枠組みを実証する。
解剖学的制約は、心筋内のトランスフォーマーの注意を集中させ、既知のCA病理の領域に一致した解釈可能な注意マップを生成する。
さらに、ViACTは、特殊なトラッキングネットワークで使用される相関ボリュームなどのタスク固有のコンポーネントを必要とせずに、心筋ポイントトラッキングに一般化する。
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