論文の概要: Evaluating New AI Cell Foundation Models on Challenging Kidney Pathology Cases Unaddressed by Previous Foundation Models
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2510.01287v1
- Date: Wed, 01 Oct 2025 00:38:36 GMT
- ステータス: 翻訳完了
- システム内更新日: 2025-10-03 16:59:20.791758
- Title: Evaluating New AI Cell Foundation Models on Challenging Kidney Pathology Cases Unaddressed by Previous Foundation Models
- Title(参考訳): 狂犬病治療におけるAI細胞基盤モデルの評価 : 既往のファンデーションモデルによる検討
- Authors: Runchen Wang, Junlin Guo, Siqi Lu, Ruining Deng, Zhengyi Lu, Yanfan Zhu, Yuechen Yang, Chongyu Qu, Yu Wang, Shilin Zhao, Catie Chang, Mitchell Wilkes, Mengmeng Yin, Haichun Yang, Yuankai Huo,
- Abstract要約: 正確な細胞核のセグメンテーションは、腎病理における下流のタスクに重要である。
我々は、2024年以前に開発された3つの広く使われている細胞基盤モデルに対して、高度なAI細胞基盤モデルをベンチマークした。
CellViT++ [Virchow] は,2,091個の試行錯誤サンプルに対して "Good" と評価された40.3%の予測で,スタンドアローンのパフォーマンスが最も高い。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 7.770106550946461
- License: http://arxiv.org/licenses/nonexclusive-distrib/1.0/
- Abstract: Accurate cell nuclei segmentation is critical for downstream tasks in kidney pathology and remains a major challenge due to the morphological diversity and imaging variability of renal tissues. While our prior work has evaluated early-generation AI cell foundation models in this domain, the effectiveness of recent cell foundation models remains unclear. In this study, we benchmark advanced AI cell foundation models (2025), including CellViT++ variants and Cellpose-SAM, against three widely used cell foundation models developed prior to 2024, using a diverse large-scale set of kidney image patches within a human-in-the-loop rating framework. We further performed fusion-based ensemble evaluation and model agreement analysis to assess the segmentation capabilities of the different models. Our results show that CellViT++ [Virchow] yields the highest standalone performance with 40.3% of predictions rated as "Good" on a curated set of 2,091 challenging samples, outperforming all prior models. In addition, our fused model achieves 62.2% "Good" predictions and only 0.4% "Bad", substantially reducing segmentation errors. Notably, the fusion model (2025) successfully resolved the majority of challenging cases that remained unaddressed in our previous study. These findings demonstrate the potential of AI cell foundation model development in renal pathology and provide a curated dataset of challenging samples to support future kidney-specific model refinement.
- Abstract(参考訳): 正確な細胞核セグメンテーションは、腎病理の下流作業において重要であり、腎組織の形態的多様性と画像的多様性のために依然として大きな課題である。
我々の以前の研究は、この領域における初期世代のAI細胞基盤モデルを評価してきたが、最近の細胞基盤モデルの有効性は未だ不明である。
本研究では,2024年以前に開発されたCellViT++とCellpose-SAMを含む先進的なAI細胞基盤モデル(2025)を,ヒト・イン・ザ・ループ評価フレームワーク内の腎画像パッチの多種多様な大規模セットを用いてベンチマークした。
さらに,異なるモデルのセグメンテーション能力を評価するために,融合に基づくアンサンブル評価とモデル合意解析を行った。
この結果から,CellViT++ [Virchow] は,2,091個の試行錯誤サンプルに対して,40.3%の予測を "Good" と評価し,すべての先行モデルを上回った。
さらに, 融合モデルでは62.2%の"Good"予測と0.4%の"Bad"予測が達成され, セグメンテーションエラーを大幅に低減した。
とくに、2025年の融合モデルでは、これまでの研究で未解決であった課題のほとんどを解決できた。
これらの結果は, 腎病理学におけるAI細胞基盤モデル開発の可能性を示し, 将来の腎特異的モデル改良を支援するために, 挑戦的なサンプルを収集したデータセットを提供する。
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