論文の概要: nnSAM2: nnUNet-Enhanced One-Prompt SAM2 for Few-shot Multi-Modality Segmentation and Composition Analysis of Lumbar Paraspinal Muscles
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2510.05555v1
- Date: Tue, 07 Oct 2025 03:53:47 GMT
- ステータス: 翻訳完了
- システム内更新日: 2025-10-27 22:13:09.31103
- Title: nnSAM2: nnUNet-Enhanced One-Prompt SAM2 for Few-shot Multi-Modality Segmentation and Composition Analysis of Lumbar Paraspinal Muscles
- Title(参考訳): nnSAM2: nnUNet-Enhanced One-Prompt SAM2 for Few-shot Multi-Modality Segmentation and composition Analysis of Lumbar Paraspinal muscles
- Authors: Zhongyi Zhang, Julie A. Hides, Enrico De Martino, Abdul Joseph Fofanah, Gervase Tuxworth,
- Abstract要約: No-New SAM2 (nnsam2) は多目的腰椎脊髄筋(LPM)セグメンテーションのための数発の枠組みである。
6つのデータセットにわたる722人の参加者から1,219件のスキャンを振り返って分析した。
nnsam2は、バニラSAM2、医療用変種であるTotalSegmentator、および主要な数発撮影法より優れ、MR画像では0.94-0.96、CTでは0.92-0.93のDSCを達成した。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 5.051796368536088
- License: http://arxiv.org/licenses/nonexclusive-distrib/1.0/
- Abstract: Purpose: To develop and validate No-New SAM2 (nnsam2) for few-shot segmentation of lumbar paraspinal muscles using only a single annotated slice per dataset, and to assess its statistical comparability with expert measurements across multi-sequence MRI and multi-protocol CT. Methods: We retrospectively analyzed 1,219 scans (19,439 slices) from 762 participants across six datasets. Six slices (one per dataset) served as labeled examples, while the remaining 19,433 slices were used for testing. In this minimal-supervision setting, nnsam2 used single-slice SAM2 prompts to generate pseudo-labels, which were pooled across datasets and refined through three sequential, independent nnU-Net models. Segmentation performance was evaluated using the Dice similarity coefficient (DSC), and automated measurements-including muscle volume, fat ratio, and CT attenuation-were assessed with two one-sided tests (TOST) and intraclass correlation coefficients (ICC). Results: nnsam2 outperformed vanilla SAM2, its medical variants, TotalSegmentator, and the leading few-shot method, achieving DSCs of 0.94-0.96 on MR images and 0.92-0.93 on CT. Automated and expert measurements were statistically equivalent for muscle volume (MRI/CT), CT attenuation, and Dixon fat ratio (TOST, P < 0.05), with consistently high ICCs (0.86-1.00). Conclusion: We developed nnsam2, a state-of-the-art few-shot framework for multi-modality LPM segmentation, producing muscle volume (MRI/CT), attenuation (CT), and fat ratio (Dixon MRI) measurements that were statistically comparable to expert references. Validated across multimodal, multicenter, and multinational cohorts, and released with open code and data, nnsam2 demonstrated high annotation efficiency, robust generalizability, and reproducibility.
- Abstract(参考訳): 目的:No-New SAM2 (nnsam2) を1データセットあたり1つの注釈付きスライスのみを用いて数発の腰椎傍脊髄筋の切片分割に対して開発し, 評価し, 多列MRIおよびマルチプロトコールCTを用いて, その統計的適合性を評価すること。
方法: 6つのデータセットにわたる722人の参加者から1,219のスキャン(19,439スライス)を振り返って分析した。
6つのスライス(1データセット当たり1個)がラベル付き例として機能し、残りの19,433個のスライスがテストに使用された。
この最小限のスーパービジョン設定では、nnsam2はシングルスライスSAM2プロンプトを使用して擬似ラベルを生成する。
Dice similarity coefficient (DSC) を用いてセグメンテーション性能を評価し, 片側試験 (TOST) とクラス内相関係数 (ICC) による自動測定, 筋容積, 脂肪比, CT減衰率を測定した。
結果: nnsam2 はバニラSAM2, 医療用変種であるTotalSegmentator, および先進的な数点撮影法に優れ, MR画像では 0.94-0.96 , CTでは 0.92-0.93 であった。
自動および専門的測定は、筋容積(MRI/CT)、CT減衰、ディクソン脂肪比(TOST, P < 0.05)に統計的に等価であり、常に高いICC(0.86-1.00)であった。
結語: nnsam2は多相性LPMセグメンテーションのための最先端のマイクロショットフレームワークで, 筋容積(MRI/CT), 減衰(CT), 脂肪比(Dixon MRI)を計測し, 専門的基準と統計的に比較した。
マルチモーダル、マルチセンター、多国籍コホートにまたがって検証され、オープンコードとデータによってリリースされ、nnsam2は高いアノテーション効率、堅牢な一般化性、再現性を示した。
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