論文の概要: Full segmentation annotations of 3D time-lapse microscopy images of MDA231 cells
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2510.10797v1
- Date: Sun, 12 Oct 2025 20:31:40 GMT
- ステータス: 翻訳完了
- システム内更新日: 2025-10-14 18:06:30.10915
- Title: Full segmentation annotations of 3D time-lapse microscopy images of MDA231 cells
- Title（参考訳）: MDA231細胞の3次元時間分解顕微鏡像のフルセグメンテーションアノテーション
- Authors: Aleksandra Melnikova, Petr Matula,
- Abstract要約: Melnikova, A. & Matula, P., 2025)では,移動細胞の3Dタイムラプス・セグメンテーション・アノテーションとして初めて公開された。
本論文は,出版スペースの制限により,Melnikova, A., & Matula, P., 2025) に含まれなかったデータセットの包括的記述と,それに伴う実験を行うことを目的としている。
- 参考スコア（独自算出の注目度）: 45.956750849861315
- License: http://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
- Abstract: High-quality, publicly available segmentation annotations of image and video datasets are critical for advancing the field of image processing. In particular, annotations of volumetric images of a large number of targets are time-consuming and challenging. In (Melnikova, A., & Matula, P., 2025), we presented the first publicly available full 3D time-lapse segmentation annotations of migrating cells with complex dynamic shapes. Concretely, three distinct humans annotated two sequences of MDA231 human breast carcinoma cells (Fluo-C3DL-MDA231) from the Cell Tracking Challenge (CTC). This paper aims to provide a comprehensive description of the dataset and accompanying experiments that were not included in (Melnikova, A., & Matula, P., 2025) due to limitations in publication space. Namely, we show that the created annotations are consistent with the previously published tracking markers provided by the CTC organizers and the segmentation accuracy measured based on the 2D gold truth of CTC is within the inter-annotator variability margins. We compared the created 3D annotations with automatically created silver truth provided by CTC. We have found the proposed annotations better represent the complexity of the input images. The presented annotations can be used for testing and training cell segmentation, or analyzing 3D shapes of highly dynamic objects.
- Abstract（参考訳）: 画像データセットとビデオデータセットの高品質で一般公開されたセグメンテーションアノテーションは、画像処理の分野を前進させる上で重要である。
特に、多数のターゲットのボリューム画像のアノテーションは、時間がかかり、困難である。
Melnikova, A. & Matula, P., 2025) では, 複雑な動的形状を持つ移動細胞の3次元時間ラプス分割アノテーションを初めて公開した。
具体的には、3人の異なるヒトがCTC(Cell Tracking Challenge)からMDA231ヒト乳癌細胞(Fluo-C3DL-MDA231)の2つの配列に注釈を付けた。
本論文は,出版スペースの制限により,Melnikova, A., & Matula, P., 2025) に含まれなかったデータセットの包括的記述と,それに伴う実験を行うことを目的としている。
すなわち、生成したアノテーションは、CTCオーガナイザが提供した追跡マーカーと一致しており、CTCの2Dゴールド真理に基づいて測定されたセグメンテーション精度は、アノテータ間の変数マージン内にあることを示す。
生成した3DアノテーションとCTCが提供する銀の真実を比較検討した。
提案したアノテーションは入力画像の複雑さを表すのがよいことがわかった。
提示されたアノテーションは、セルセグメンテーションのテストやトレーニング、あるいは非常にダイナミックなオブジェクトの3D形状の分析に使用することができる。
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