論文の概要: 3D Vascular Segmentation Supervised by 2D Annotation of Maximum
Intensity Projection
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2402.12128v1
- Date: Mon, 19 Feb 2024 13:24:46 GMT
- ステータス: 処理完了
- システム内更新日: 2024-02-20 16:39:51.484635
- Title: 3D Vascular Segmentation Supervised by 2D Annotation of Maximum
Intensity Projection
- Title(参考訳): 最大強度投影の2次元アノテーションによる3次元血管分割
- Authors: Zhanqiang Guo and Zimeng Tan and Jianjiang Feng and Jie Zhou
- Abstract要約: 血管構造のセグメンテーションは、医学的分析と臨床応用において重要な役割を担っている。
既存の弱監督法は, スパース血管構造を扱う際に, 最適下肢機能を示した。
ここでは,3次元体積の次元を2次元画像に変換するために,最大強度投影(MIP)を用いる。
MIPを介して2D-3Dの深い特徴を融合してセグメンテーション性能を向上させる弱教師付きネットワークを導入する。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 33.34240545722551
- License: http://arxiv.org/licenses/nonexclusive-distrib/1.0/
- Abstract: Vascular structure segmentation plays a crucial role in medical analysis and
clinical applications. The practical adoption of fully supervised segmentation
models is impeded by the intricacy and time-consuming nature of annotating
vessels in the 3D space. This has spurred the exploration of weakly-supervised
approaches that reduce reliance on expensive segmentation annotations. Despite
this, existing weakly supervised methods employed in organ segmentation, which
encompass points, bounding boxes, or graffiti, have exhibited suboptimal
performance when handling sparse vascular structure. To alleviate this issue,
we employ maximum intensity projection (MIP) to decrease the dimensionality of
3D volume to 2D image for efficient annotation, and the 2D labels are utilized
to provide guidance and oversight for training 3D vessel segmentation model.
Initially, we generate pseudo-labels for 3D blood vessels using the annotations
of 2D projections. Subsequently, taking into account the acquisition method of
the 2D labels, we introduce a weakly-supervised network that fuses 2D-3D deep
features via MIP to further improve segmentation performance. Furthermore, we
integrate confidence learning and uncertainty estimation to refine the
generated pseudo-labels, followed by fine-tuning the segmentation network. Our
method is validated on five datasets (including cerebral vessel, aorta and
coronary artery), demonstrating highly competitive performance in segmenting
vessels and the potential to significantly reduce the time and effort required
for vessel annotation. Our code is available at:
https://github.com/gzq17/Weakly-Supervised-by-MIP.
- Abstract(参考訳): 血管構造のセグメンテーションは、医学的分析と臨床応用において重要な役割を果たす。
完全教師付きセグメンテーションモデルの実践的導入は、3次元空間におけるアノテート容器の複雑で時間を要する性質によって妨げられる。
このことが、高価なセグメンテーションアノテーションへの依存を減らす弱い教師付きアプローチの探求を促した。
それにもかかわらず、臓器分節法(点、境界箱、落書きを含む)では、スパース血管構造を扱う際には、最適以下の性能を示す。
この問題を緩和するために,我々は3次元体積の次元を2次元画像に縮小するために最大強度投影(MIP)を用い,その2次元ラベルを用いて3次元血管セグメンテーションモデルをトレーニングするためのガイダンスと監視を行う。
まず2次元投影のアノテーションを用いて3次元血管の擬似ラベルを生成する。
次に,2Dラベルの取得手法を考慮し,MIPを介して2D-3Dの深い特徴を融合させてセグメンテーション性能を向上させる弱教師付きネットワークを導入する。
さらに,信頼度学習と不確実性推定を統合し,生成された擬似ラベルを洗練し,セグメンテーションネットワークを微調整する。
本手法は5つのデータセット(脳血管,大動脈,冠動脈を含む)で検証され,分画血管における高い競合性を示し,血管注記に必要な時間と労力を大幅に削減する可能性を示す。
私たちのコードは、https://github.com/gzq17/Weakly-Supervised-by-MIPで利用可能です。
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