論文の概要: Generative Modeling Enables Molecular Structure Retrieval from Coulomb Explosion Imaging
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2511.00179v1
- Date: Fri, 31 Oct 2025 18:33:40 GMT
- ステータス: 翻訳完了
- システム内更新日: 2025-11-05 16:37:26.654414
- Title: Generative Modeling Enables Molecular Structure Retrieval from Coulomb Explosion Imaging
- Title(参考訳): クーロン爆発画像からの分子構造検索を可能にする生成モデリング
- Authors: Xiang Li, Till Jahnke, Rebecca Boll, Jiaqi Han, Minkai Xu, Michael Meyer, Maria Novella Piancastelli, Daniel Rolles, Artem Rudenko, Florian Trinter, Thomas J. A. Wolf, Jana B. Thayer, James P. Cryan, Stefano Ermon, Phay J. Ho,
- Abstract要約: 拡散型トランスフォーマーニューラルネットワークを用いて、イオン-モーメント分布から未知のジオメトリを再構成する。
ネットワークは1ボア半径以下の平均絶対誤差でイオン-分子分布から未知の分子構造を再構成することを示す。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 46.04582001144512
- License: http://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
- Abstract: Capturing the structural changes that molecules undergo during chemical reactions in real space and time is a long-standing dream and an essential prerequisite for understanding and ultimately controlling femtochemistry. A key approach to tackle this challenging task is Coulomb explosion imaging, which benefited decisively from recently emerging high-repetition-rate X-ray free-electron laser sources. With this technique, information on the molecular structure is inferred from the momentum distributions of the ions produced by the rapid Coulomb explosion of molecules. Retrieving molecular structures from these distributions poses a highly non-linear inverse problem that remains unsolved for molecules consisting of more than a few atoms. Here, we address this challenge using a diffusion-based Transformer neural network. We show that the network reconstructs unknown molecular geometries from ion-momentum distributions with a mean absolute error below one Bohr radius, which is half the length of a typical chemical bond.
- Abstract(参考訳): 実空間と時間における化学反応中の分子の構造変化を捉えることは、長年の夢であり、フェムトケミカルを理解し、最終的に制御するために必須の前提条件である。
この課題に取り組むための重要なアプローチはクーロン爆発画像(英語版)であり、これは最近出現した高繰り返しのX線自由電子レーザー源から決定的に恩恵を受けている。
この手法により、分子の急激なクーロン爆発によって生じるイオンの運動量分布から分子構造に関する情報が推測される。
これらの分布から分子構造を回収することは、数原子以上からなる分子に対して未解決のままである非常に非線形逆問題を引き起こす。
本稿では拡散型トランスフォーマーニューラルネットワークを用いてこの問題に対処する。
このネットワークは、典型的な化学結合の半分の長さであるボーア半径以下の平均絶対誤差で、イオン-モーメント分布から未知の分子構造を再構成することを示す。
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