論文の概要: Split-Flows: Measure Transport and Information Loss Across Molecular Resolutions
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2511.01464v1
- Date: Mon, 03 Nov 2025 11:23:13 GMT
- ステータス: 翻訳完了
- システム内更新日: 2025-11-05 16:37:27.238771
- Title: Split-Flows: Measure Transport and Information Loss Across Molecular Resolutions
- Title(参考訳): スプリットフロー:分子分解能全体での輸送と情報損失を測定する
- Authors: Sander Hummerich, Tristan Bereau, Ullrich Köthe,
- Abstract要約: フローベースのアプローチであるスプリットフローを導入し、バックマッピングを解像度をまたいだ継続的な時間計測のトランスポートとして再解釈する。
キグノリン, 脂質二分子膜, アラニンジペプチドなど, 多様な分子系においてこれらの機能を示す。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 7.739380063367548
- License: http://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
- Abstract: By reducing resolution, coarse-grained models greatly accelerate molecular simulations, unlocking access to long-timescale phenomena, though at the expense of microscopic information. Recovering this fine-grained detail is essential for tasks that depend on atomistic accuracy, making backmapping a central challenge in molecular modeling. We introduce split-flows, a novel flow-based approach that reinterprets backmapping as a continuous-time measure transport across resolutions. Unlike existing generative strategies, split-flows establish a direct probabilistic link between resolutions, enabling expressive conditional sampling of atomistic structures and -- for the first time -- a tractable route to computing mapping entropies, an information-theoretic measure of the irreducible detail lost in coarse-graining. We demonstrate these capabilities on diverse molecular systems, including chignolin, a lipid bilayer, and alanine dipeptide, highlighting split-flows as a principled framework for accurate backmapping and systematic evaluation of coarse-grained models.
- Abstract(参考訳): 分解能を低下させることで、粗粒度モデルは分子シミュレーションを大幅に加速し、微視的な情報を犠牲にして、長時間の現象へのアクセスを解き放つ。
このきめ細かい詳細を復元することは、原子の精度に依存するタスクに不可欠であり、分子モデリングにおいてバックマッピングが中心的な課題となっている。
スプリットフローは,バックマッピングを分解能を横断する連続的な計測手段として再解釈する,新しいフローベースのアプローチである。
既存の生成戦略とは異なり、分割フローは解像度間の直接確率的リンクを確立し、原子構造を表現的条件でサンプリングし、そして--初めて--マッピングのエントロピーを計算するための引き込み可能なルート、粗粒化で失われた既約詳細に関する情報理論の計測を可能にする。
本研究では, キグノリン, 脂質二分子膜, アラニンジペプチドなどの種々の分子系において, 正確なバックマッピングの原理としてスプリットフローを強調し, 粗粒モデルの体系的評価を行った。
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