論文の概要: Dynamic causal discovery in Alzheimer's disease through latent pseudotime modelling
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2511.04619v1
- Date: Thu, 06 Nov 2025 18:12:09 GMT
- ステータス: 翻訳完了
- システム内更新日: 2025-11-07 20:17:53.553039
- Title: Dynamic causal discovery in Alzheimer's disease through latent pseudotime modelling
- Title(参考訳): 潜在性擬似時間モデリングによるアルツハイマー病の動的因果発見
- Authors: Natalia Glazman, Jyoti Mangal, Pedro Borges, Sebastien Ourselin, M. Jorge Cardoso,
- Abstract要約: そこで本研究では,従来の潜伏変数モデルを現実のアルツハイマー病データに適用し,慢性期とは無関係にデータ駆動性疾患の軌跡に沿って患者に指示する擬似時刻を推定する。
本稿では,新しいマーカーと確立されたADマーカーとの動的相互作用を明らかにする。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 1.1222071637855076
- License: http://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
- Abstract: The application of causal discovery to diseases like Alzheimer's (AD) is limited by the static graph assumptions of most methods; such models cannot account for an evolving pathophysiology, modulated by a latent disease pseudotime. We propose to apply an existing latent variable model to real-world AD data, inferring a pseudotime that orders patients along a data-driven disease trajectory independent of chronological age, then learning how causal relationships evolve. Pseudotime outperformed age in predicting diagnosis (AUC 0.82 vs 0.59). Incorporating minimal, disease-agnostic background knowledge substantially improved graph accuracy and orientation. Our framework reveals dynamic interactions between novel (NfL, GFAP) and established AD markers, enabling practical causal discovery despite violated assumptions.
- Abstract(参考訳): アルツハイマー病(AD)のような疾患への因果発見の応用は、ほとんどの方法の静的グラフ仮定によって制限される。
実世界のADデータに既存の潜伏変数モデルを適用し、時系列年齢に依存しないデータ駆動型疾患軌跡に沿って患者に指示する擬似時刻を推定し、因果関係の進化を学習する。
診断予測年齢(AUC 0.82 vs 0.59)は偽時間より優れていた。
最小限の疾患に依存しない背景知識を取り入れることで、グラフの精度と向きが大幅に向上した。
提案手法は, 新規(NfL, GFAP)と確立されたADマーカーとの動的相互作用を明らかにする。
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