論文の概要: Multimodal Posterior Sampling-based Uncertainty in PD-L1 Segmentation from H&E Images
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2511.11486v1
- Date: Fri, 14 Nov 2025 17:05:13 GMT
- ステータス: 翻訳完了
- システム内更新日: 2025-11-17 22:42:18.736907
- Title: Multimodal Posterior Sampling-based Uncertainty in PD-L1 Segmentation from H&E Images
- Title(参考訳): H&E画像からのPD-L1セグメンテーションにおけるマルチモーダル後部サンプリングに基づく不確かさ
- Authors: Roman Kinakh, Gonzalo R. Ríos-Muñoz, Arrate Muñoz-Barrutia,
- Abstract要約: 本稿では,H&E染色組織像から直接PD-L1の発現を推定するベイズ分類フレームワークnnUNet-Bを提案する。
肺扁平上皮癌のデータセットを用いて,本手法は確立された基線に対する競合性を示す。
これらの結果は、不確実性を考慮したH&EベースのPD-L1予測が、スケーラブルで解釈可能なバイオマーカー評価への有望なステップであることを示唆している。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 0.4697971908036153
- License: http://arxiv.org/licenses/nonexclusive-distrib/1.0/
- Abstract: Accurate assessment of PD-L1 expression is critical for guiding immunotherapy, yet current immunohistochemistry (IHC) based methods are resource-intensive. We present nnUNet-B: a Bayesian segmentation framework that infers PD-L1 expression directly from H&E-stained histology images using Multimodal Posterior Sampling (MPS). Built upon nnUNet-v2, our method samples diverse model checkpoints during cyclic training to approximate the posterior, enabling both accurate segmentation and epistemic uncertainty estimation via entropy and standard deviation. Evaluated on a dataset of lung squamous cell carcinoma, our approach achieves competitive performance against established baselines with mean Dice Score and mean IoU of 0.805 and 0.709, respectively, while providing pixel-wise uncertainty maps. Uncertainty estimates show strong correlation with segmentation error, though calibration remains imperfect. These results suggest that uncertainty-aware H&E-based PD-L1 prediction is a promising step toward scalable, interpretable biomarker assessment in clinical workflows.
- Abstract(参考訳): PD-L1発現の正確な評価は、免疫療法の指針として重要であるが、現在の免疫組織化学(IHC)に基づく手法は資源集約的である。
本稿では,H&E-stained histology image から直接 PD-L1 を推定するベイズ分類フレームワーク nnUNet-B について述べる。
本手法は, nUNet-v2に基づいて, サイクリックトレーニング中の様々なモデルチェックポイントを抽出し, 後方部を近似し, エントロピーと標準偏差による正確なセグメンテーションとてんかん不確実性評価の両立を可能にする。
肺扁平上皮癌のデータセットを用いて,Dice Score の平均値と 0.805 と 0.709 の IoU の平均値とを比較検討した。
不確実性推定はセグメンテーション誤差と強い相関を示すが、キャリブレーションは不完全なままである。
これらの結果は,不確実性を考慮したH&EベースのPD-L1予測が,臨床ワークフローにおけるスケーラブルで解釈可能なバイオマーカー評価への有望な一歩であることを示唆している。
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