論文の概要: Deep Learning with Uncertainty Quantification for Predicting the Segmentation Dice Coefficient of Prostate Cancer Biopsy Images
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2109.00115v2
- Date: Fri, 27 Dec 2024 22:21:01 GMT
- ステータス: 翻訳完了
- システム内更新日: 2024-12-31 16:01:50.283171
- Title: Deep Learning with Uncertainty Quantification for Predicting the Segmentation Dice Coefficient of Prostate Cancer Biopsy Images
- Title(参考訳): 前立腺癌生検画像の偏差係数予測のための不確かさ定量化による深層学習
- Authors: Audrey Xie, Elhoucine Elfatimi, Sambuddha Ghosal, Pratik Shah,
- Abstract要約: 深層学習モデル(DLM)は病理組織像の分類と分類において最先端のパフォーマンスを達成することができる。
DLMの不確実性推定は、さらなるレビューを必要とする予測や画像を特定することによって信頼を高めることができる。
本研究は,無作為重量法とモンテカルロ下降法を用いて不確実性評価を訓練したDLMを用いて,顕微鏡的ヘマトキシリンおよびエオシン色素染色前立腺核生検組織像RGB画像から腫瘍を分離した。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 0.7499722271664147
- License:
- Abstract: Deep learning models (DLMs) can achieve state-of-the-art performance in histopathology image segmentation and classification, but have limited deployment potential in real-world clinical settings. Uncertainty estimates of DLMs can increase trust by identifying predictions and images that need further review. Dice scores and coefficients (Dice) are benchmarks for evaluation of image segmentation performance, but are usually not evaluated with DLM uncertainty quantification. This study reports DLMs trained with uncertainty estimations, using randomly initialized weights and Monte Carlo dropout, to segment tumors from microscopic Hematoxylin and Eosin dye stained prostate core biopsy histology RGB images. Image-level maps showed significant correlation (Spearman's rank, p < 0.05) between overall and specific prostate tissue image sub-region uncertainties with model performance estimations by Dice. This study reports that linear models, which can predict Dice segmentation scores from multiple clinical sub-region-based uncertainties of prostate cancer, can serve as a more comprehensive performance evaluation metric without loss in predictive capability of DLMs, with a low root mean square error.
- Abstract(参考訳): 深層学習モデル(DLM)は、病理組織像の分類と分類において最先端のパフォーマンスを達成できるが、実際の臨床環境での展開可能性には限界がある。
DLMの不確実性推定は、さらなるレビューを必要とする予測や画像を特定することによって信頼を高めることができる。
ディススコアと係数(ディススコア、Dice scores and coefficients, Dice)は、画像分割性能を評価するためのベンチマークであるが、通常、DLMの不確かさの定量化では評価されない。
本研究は,無作為初期化重量法とモンテカルロ減量法を用いて不確実性評価を訓練したDLMを用いて,顕微鏡的ヘマトキシリンおよびエオシン染色前立腺核生検組織像RGB画像から腫瘍を分離した。
画像レベルマップではDiceによるモデル性能評価と, 全身および特定の前立腺組織像との有意な相関 (Spearman's rank, p < 0.05) を示した。
本研究は,DLMの予測能力を損なうことなく,Diceセグメンテーションスコアを複数の臨床領域による前立腺癌の領域別不確実性から予測できる線形モデルにより,DLMの予測精度を損なうことなく,より総合的なパフォーマンス評価指標として機能しうることを報告する。
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