論文の概要: Real-time prediction of breast cancer sites using deformation-aware graph neural network
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2511.13082v1
- Date: Mon, 17 Nov 2025 07:32:28 GMT
- ステータス: 翻訳完了
- システム内更新日: 2025-11-18 14:36:24.903634
- Title: Real-time prediction of breast cancer sites using deformation-aware graph neural network
- Title(参考訳): 変形認識型グラフニューラルネットワークを用いた乳癌部位のリアルタイム予測
- Authors: Kyunghyun Lee, Yong-Min Shin, Minwoo Shin, Jihun Kim, Sunghwan Lim, Won-Yong Shin, Kyungho Yoon,
- Abstract要約: 本研究では, 生検中の乳癌部位をリアルタイムで正確に予測できるグラフニューラルネットワーク(GNN)モデルを開発した。
このモデルをファントムと実際の患者データセットを用いて検証し,癌リンパ節変位の精度を0.2ミリメートル (mm) 以内で達成した。
提案した変形認識型GNNモデルは,乳房生検におけるリアルタイムな腫瘍変位予測に有望なソリューションを提供する。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 18.41781547416937
- License: http://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
- Abstract: Early diagnosis of breast cancer is crucial, enabling the establishment of appropriate treatment plans and markedly enhancing patient prognosis. While direct magnetic resonance imaging-guided biopsy demonstrates promising performance in detecting cancer lesions, its practical application is limited by prolonged procedure times and high costs. To overcome these issues, an indirect MRI-guided biopsy that allows the procedure to be performed outside of the MRI room has been proposed, but it still faces challenges in creating an accurate real-time deformable breast model. In our study, we tackled this issue by developing a graph neural network (GNN)-based model capable of accurately predicting deformed breast cancer sites in real time during biopsy procedures. An individual-specific finite element (FE) model was developed by incorporating magnetic resonance (MR) image-derived structural information of the breast and tumor to simulate deformation behaviors. A GNN model was then employed, designed to process surface displacement and distance-based graph data, enabling accurate prediction of overall tissue displacement, including the deformation of the tumor region. The model was validated using phantom and real patient datasets, achieving an accuracy within 0.2 millimeters (mm) for cancer node displacement (RMSE) and a dice similarity coefficient (DSC) of 0.977 for spatial overlap with actual cancerous regions. Additionally, the model enabled real-time inference and achieved a speed-up of over 4,000 times in computational cost compared to conventional FE simulations. The proposed deformation-aware GNN model offers a promising solution for real-time tumor displacement prediction in breast biopsy, with high accuracy and real-time capability. Its integration with clinical procedures could significantly enhance the precision and efficiency of breast cancer diagnosis.
- Abstract(参考訳): 乳がんの早期診断は重要であり,適切な治療計画が確立され,予後が著しく向上した。
直接磁気共鳴画像誘導生検は癌病変の検出において有望な性能を示すが、その実用化は長い手術時間と高いコストで制限される。
これらの問題を克服するために、MRI室外での手術を可能にする間接的なMRI誘導生検が提案されているが、正確なリアルタイムな変形可能な乳房モデルを作成する上で、依然として課題に直面している。
本研究では, 生検中の乳癌部位をリアルタイムで正確に予測できるグラフニューラルネットワーク(GNN)モデルを構築し, この問題に対処した。
乳腺と腫瘍のMRI画像から得られる構造情報を組み込んで, 変形挙動をシミュレートすることにより, 個々の有限要素(FE)モデルを開発した。
その後、GNNモデルを用いて表面変位と距離に基づくグラフデータを処理し、腫瘍領域の変形を含む組織全体の変位を正確に予測できるように設計された。
このモデルはファントムと実際の患者データセットを用いて検証され、癌リンパ節変位(RMSE)の0.2ミリ秒以内の精度と、実際のがん領域と空間的に重なる0.977のダイス類似度係数(DSC)が得られた。
さらに、このモデルはリアルタイムの推論を可能にし、従来のFEシミュレーションと比較して4000倍以上の計算コストの高速化を実現した。
提案した変形認識型GNNモデルにより,胸部生検におけるリアルタイム腫瘍変位予測を高精度かつリアルタイムに行うことが可能となる。
臨床試験と統合することで、乳がん診断の精度と効率を大幅に向上させることができる。
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