論文の概要: Reconstruction of three-dimensional shapes of normal and disease-related erythrocytes from partial observations using multi-fidelity neural networks
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2511.14962v1
- Date: Tue, 18 Nov 2025 23:04:13 GMT
- ステータス: 翻訳完了
- システム内更新日: 2025-11-20 15:51:28.557197
- Title: Reconstruction of three-dimensional shapes of normal and disease-related erythrocytes from partial observations using multi-fidelity neural networks
- Title(参考訳): 多要素ニューラルネットワークによる正常および疾患関連赤血球の三次元形状の再構成
- Authors: Haizhou Wen, He Li, Zhen Li,
- Abstract要約: 3次元赤血球または赤血球の形態を部分観察から再構築することは、RBCの老化と様々なRBC疾患の病態を理解するのに不可欠である。
RBCの高忠実度断面を融合するMFNN手法を提案し, 形状的に類似した低忠実度参照3DRBC形状を用いて, 完全な3次元表面を復元する。
以上の結果から,MFNN予測器は,少なくとも2つの斜め断面を持つ場合,95%以上の座標精度で複雑なRBC形態を再構築可能であることがわかった。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 7.337452993095275
- License: http://arxiv.org/licenses/nonexclusive-distrib/1.0/
- Abstract: Reconstruction of 3D erythrocyte or red blood cell (RBC) morphology from partial observations, such as microscope images, is essential for understanding the physiology of RBC aging and the pathology of various RBC disorders. In this study, we propose a multi-fidelity neural network (MFNN) approach to fuse high-fidelity cross-sections of an RBC, with a morphologically similar low-fidelity reference 3D RBC shape to recover its full 3D surface. The MFNN predictor combines a convolutional neural network trained on low-fidelity reference RBC data with a feedforward neural network that captures nonlinear morphological correlations, and augments training with surface area and volume constraints for regularization in the low-fidelity branch. This approach is theoretically grounded by a topological homeomorphism between a sphere and 3D RBC surfaces, with training data generated by dissipative particle dynamics simulations of stomatocyte-discocyte-echinocyte transformation. Benchmarking across diverse RBC shapes observed in normal and aged populations, our results show that the MFNN predictor can reconstruct complex RBC morphologies with over 95% coordinate accuracy when provided with at least two orthogonal cross-sections. It is observed that informative oblique cross-sections intersecting spicule tips of echinocytes improve both local and global feature reconstruction, highlighting the value of feature-aware sampling. Our study further evaluates the influence of sampling strategies, shape dissimilarity, and noise, showing enhanced robustness under physically constrained training. Altogether, these results demonstrate the capability of MFNN to reconstruct the 3D shape of normal and aged RBCs from partial cross-sections as observed in conventional microscope images, which could facilitate the quantitative analysis of RBC morphological parameters in normal and disease-related RBC samples.
- Abstract(参考訳): 3次元赤血球または赤血球の形態を顕微鏡画像などの部分的観察から再構築することは、RBC加齢の生理学と様々なRBC疾患の病態を理解するのに不可欠である。
本研究では, RBC の高密度断面を融合する多次元ニューラルネットワーク (MFNN) を提案し, 形状的に類似した低密度参照3D RBC 形状を用いて, 完全な3次元表面を復元する。
MFNN予測器は、低忠実度参照RBCデータに基づいてトレーニングされた畳み込みニューラルネットワークと非線形形態的相関をキャプチャするフィードフォワードニューラルネットワークを結合し、低忠実度分岐における正規化のための表面積と体積制限によるトレーニングを強化する。
この手法は、球面と3次元RBC表面の間のトポロジカルな同相性によって理論的に基礎付けられ、ストマトサイト-細胞-エキノサイト変換の散逸的粒子動力学シミュレーションによって生成されたトレーニングデータによって生成される。
以上の結果から,MFNN予測器は,少なくとも2つの直交断面を持つ場合,95%以上の座標精度で複雑なRBC形態を再構築可能であることが示された。
角膜の先端を交差する情報的斜め断面は局所的および大域的特徴再構成を改善し,特徴認識サンプリングの価値を強調した。
本研究は, 物理的拘束訓練におけるサンプリング戦略, 形状異方性, 騒音の影響について検討した。
これらの結果は, 従来の顕微鏡画像のように, 正常および高齢RBCの3次元形状を部分断面から再構築するMFNNの能力を示し, 正常および疾患関連RBC試料におけるRBC形態パラメータの定量的解析を容易にする。
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