論文の概要: Autonomous labeling of surgical resection margins using a foundation model
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2511.22131v1
- Date: Thu, 27 Nov 2025 05:52:42 GMT
- ステータス: 翻訳完了
- システム内更新日: 2025-12-01 19:47:55.414226
- Title: Autonomous labeling of surgical resection margins using a foundation model
- Title(参考訳): ファンデーションモデルを用いた外科的切除マージンの自動ラベル付け
- Authors: Xilin Yang, Musa Aydin, Yuhong Lu, Sahan Yoruc Selcuk, Bijie Bai, Yijie Zhang, Andrew Birkeland, Katjana Ehrlich, Julien Bec, Laura Marcu, Nir Pillar, Aydogan Ozcan,
- Abstract要約: 本研究は,全スライディング画像上で外科的切削面を自律的に局所化する仮想インクネットワーク(VIN)を提案する。
VINは、特徴抽出器として凍結基礎モデルと、因果一貫性のある特徴のパッチレベル分類のために訓練されたコンパクトな2層多層パーセプトロンを使用する。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 4.873604837915161
- License: http://arxiv.org/licenses/nonexclusive-distrib/1.0/
- Abstract: Assessing resection margins is central to pathological specimen evaluation and has profound implications for patient outcomes. Current practice employs physical inking, which is applied variably, and cautery artifacts can obscure the true margin on histological sections. We present a virtual inking network (VIN) that autonomously localizes the surgical cut surface on whole-slide images, reducing reliance on inks and standardizing margin-focused review. VIN uses a frozen foundation model as the feature extractor and a compact two-layer multilayer perceptron trained for patch-level classification of cautery-consistent features. The dataset comprised 120 hematoxylin and eosin (H&E) stained slides from 12 human tonsil tissue blocks, resulting in ~2 TB of uncompressed raw image data, where a board-certified pathologist provided boundary annotations. In blind testing with 20 slides from previously unseen blocks, VIN produced coherent margin overlays that qualitatively aligned with expert annotations across serial sections. Quantitatively, region-level accuracy was ~73.3% across the test set, with errors largely confined to limited areas that did not disrupt continuity of the whole-slide margin map. These results indicate that VIN captures cautery-related histomorphology and can provide a reproducible, ink-free margin delineation suitable for integration into routine digital pathology workflows and for downstream measurement of margin distances.
- Abstract(参考訳): 切除マージンの評価は病理検体評価の中心であり,患者の予後に重大な影響を及ぼす。
現在の慣行では物理的インキングが採用されており、これは可変的に適用され、因果的アーティファクトは、組織学的部分の真のマージンを曖昧にすることができる。
本稿では,仮想インキネットワーク(VIN)を提案する。このネットワークは,スライディング画像上で外科的切削面を自律的に局所化し,インクへの依存を低減し,マージンに着目したレビューを標準化する。
VINは、特徴抽出器として凍結基礎モデルと、因果一貫性のある特徴のパッチレベル分類のために訓練されたコンパクトな2層多層パーセプトロンを使用する。
このデータセットは120個のヘマトキシリンとエオシン(H&E)染色した12個のヒト扁桃組織ブロックから作成され、その結果、未圧縮の生画像データの約2TBが得られた。
以前は見えなかったブロックから20のスライドでブラインドテストを行い、VINはシリアルセクション全体にわたって専門家アノテーションと質的に一致した一貫性のあるマージンオーバーレイを生成した。
定量的には、領域レベルの精度はテストセット全体で約73.3%であり、誤差はスライディング・マージン・マップの連続性を損なわない限られた領域に限られていた。
以上の結果から,VINは因果関係の組織形態を把握し,正常なデジタル病理ワークフローへの統合に適した再現可能なインクフリーマージンデライン化と,マージン距離の下流測定に有効であることが示唆された。
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