論文の概要: Knowledge Graph Augmented Large Language Models for Next-Visit Disease Prediction
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2512.01210v1
- Date: Mon, 01 Dec 2025 02:49:17 GMT
- ステータス: 翻訳完了
- システム内更新日: 2025-12-02 19:46:34.648453
- Title: Knowledge Graph Augmented Large Language Models for Next-Visit Disease Prediction
- Title(参考訳): 次世代疾患予測のための知識グラフ強化大言語モデル
- Authors: Ruiyu Wang, Tuan Vinh, Ran Xu, Yuyin Zhou, Jiaying Lu, Carl Yang, Francisco Pasquel,
- Abstract要約: 知識グラフ(KG)誘導チェーン・オブ・シント(CoT)フレームワークは,MIMIC-IIIにおける来院レベルの疾患予測のための臨床基礎的推論を生成する。
ICD-9コードはPrimeKGにマッピングされ、病気関連ノードとマルチホップ推論パスが抽出され、CoT生成のための足場として使用される。
KG誘導モデルは、AUROC値0.66から0.70、マクロAUPR値0.40から0.47を達成し、強力な古典的ベースラインを上回った。
盲目臨床評価では,KG誘導型CoT説明の明瞭度,関連性,臨床正当性に一貫した嗜好を示す。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 24.992170033802537
- License: http://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
- Abstract: Electronic health records (EHRs) support powerful clinical prediction models, but existing methods typically provide coarse, post hoc explanations that offer limited value for patient-level decision making. We introduce a knowledge graph (KG)-guided chain-of-thought (CoT) framework that generates clinically grounded and temporally consistent reasoning for visit-level disease prediction in MIMIC-III. ICD-9 codes are mapped to PrimeKG, from which disease-relevant nodes and multi-hop reasoning paths are extracted and used as scaffolds for CoT generation; only explanations whose conclusions match observed outcomes are retained. Lightweight LLaMA-3.1-Instruct-8B and Gemma-7B models are then fine-tuned on this supervision corpus. Across ten PrimeKG-mapped diseases and limited training cohorts (400 and 1000 cases), KG-guided models outperform strong classical baselines, achieving AUROC values of 0.66 to 0.70 and macro-AUPR values of 0.40 to 0.47. The models also transfer zero-shot to the CRADLE cohort, improving accuracy from approximately 0.40 to 0.51 up to 0.72 to 0.77. A blinded clinician evaluation shows consistent preference for KG-guided CoT explanations in clarity, relevance, and clinical correctness.
- Abstract(参考訳): EHR(Electronic Health Record)は強力な臨床予測モデルをサポートするが、既存の方法では、患者レベルの意思決定に限られた価値を提供する粗い、ポストホックな説明を提供するのが一般的である。
我々は,MIMIC-IIIにおける訪問レベルの疾患予測のための臨床的根拠と時間的一貫した推論を生成する知識グラフ(KG)誘導チェーン・オブ・シント(CoT)フレームワークを提案する。
ICD-9コードはPrimeKGにマッピングされ、病気関連ノードとマルチホップ推論パスが抽出され、CoT生成の足場として使用される。
軽量のLLaMA-3.1-Instruct-8BとGemma-7Bは、この監督コーパスで微調整される。
10のPrimeKGマップ付き疾患と限られたトレーニングコホート(400および1000例)、KGガイド付きモデルは、AUROC値0.66から0.70、マクロAUPR値0.40から0.47を達成し、強い古典的ベースラインを上回った。
また、ゼロショットはCRADLEコホートに転送され、精度は0.40から0.51から0.72から0.77に向上した。
盲目臨床評価では,KG誘導型CoT説明の明瞭度,関連性,臨床正当性に一貫した嗜好を示す。
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