論文の概要: BioMedGPT-Mol: Multi-task Learning for Molecular Understanding and Generation

• arxiv url: http://arxiv.org/abs/2512.04629v2
• Date: Thu, 11 Dec 2025 08:24:32 GMT
• ステータス: 翻訳完了
• システム内更新日: 2025-12-12 14:11:15.079658
• Title: BioMedGPT-Mol: Multi-task Learning for Molecular Understanding and Generation
• Title（参考訳）: BioMedGPT-Mol:分子理解と生成のためのマルチタスク学習
• Authors: Chenyang Zuo, Siqi Fan, Zaiqing Nie,
• Abstract要約: 分子理解および生成タスクを支援する分子言語モデルであるBioMedGPT-Molを紹介する。 既存の公開命令データセットをキュレートして統一することにより、大規模で包括的で高品質なトレーニングデータセットを組み立てました。 そのモデルは、巧妙に設計されたマルチタスク学習フレームワークによって微調整される。
• 参考スコア（独自算出の注目度）: 9.078742514163524
• License: http://arxiv.org/licenses/nonexclusive-distrib/1.0/
• Abstract: Molecules play a crucial role in biomedical research and discovery, particularly in the field of small molecule drug development. Given the rapid advancements in large language models, especially the recent emergence of reasoning models, it is natural to explore how a general-purpose language model can be efficiently adapted for molecular science applications. In this work, we introduce BioMedGPT-Mol, a molecular language model designed to support molecular understanding and generation tasks. By curating and unifying existing public instruction datasets, we have assembled a large-scale, comprehensive, and high-quality training dataset. The model is then fine-tuned through a meticulously designed multi-task learning framework. On a consolidated benchmark derived from LlaSMol, TOMG-Bench, and MuMOInstruct, BioMedGPT-Mol achieves remarkable performance. Our experimental results demonstrate that a general-purpose reasoning model can be effectively and efficiently post-trained into a professional molecular language model through a well-structured multi-task curriculum. Leveraging these capabilities, we further apply the model to multi-step retrosynthetic planning, achieving state-of-the-art performance on RetroBench and demonstrating its superior efficacy as an end-to-end retrosynthetic planner. We anticipate that our approach can be extended to other biomedical scientific domains.
• Abstract（参考訳）: 分子は生物医学の研究や発見、特に小分子の薬物開発において重要な役割を担っている。 大規模言語モデルの急速な進歩、特に最近の推論モデルの出現を考えると、汎用言語モデルが分子科学への応用にどのように効果的に適応できるかを考察することは自然である。 本稿では,分子理解および生成タスクを支援する分子言語モデルであるBioMedGPT-Molを紹介する。 既存の公開命令データセットをキュレートして統一することにより、大規模で包括的で高品質なトレーニングデータセットを組み立てました。 そのモデルは、巧妙に設計されたマルチタスク学習フレームワークによって微調整される。 LlaSMol, TOMG-Bench, MuMOInstruct から得られた総合ベンチマークでは, BioMedGPT-Mol が顕著な性能を発揮する。 実験により, 汎用推論モデルは, 十分に構造化されたマルチタスクのカリキュラムを用いて, プロの分子言語モデルに効果的かつ効率的にポストトレーニングできることを示した。 これらの能力を生かして、このモデルを多段階の逆合成計画に適用し、RetroBenchの最先端性能を実現し、エンドツーエンドの逆合成プランナーとして優れた効果を示す。 我々は、我々のアプローチを他の生物医学的な科学領域に拡張できることを期待している。

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