論文の概要: Protein Secondary Structure Prediction Using Transformers
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2512.08613v1
- Date: Tue, 09 Dec 2025 13:58:47 GMT
- ステータス: 翻訳完了
- システム内更新日: 2025-12-10 22:28:07.984118
- Title: Protein Secondary Structure Prediction Using Transformers
- Title(参考訳): トランスを用いたタンパク質二次構造予測
- Authors: Manzi Kevin Maxime,
- Abstract要約: 本研究では,タンパク質配列データに注意機構を適用し,構造モチーフを予測するトランスフォーマーモデルを提案する。
CB513データセットにスライディングウインドウデータ拡張技術を用いてトレーニングサンプルを拡張する。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 0.0
- License: http://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
- Abstract: Predicting protein secondary structures such as alpha helices, beta sheets, and coils from amino acid sequences is essential for understanding protein function. This work presents a transformer-based model that applies attention mechanisms to protein sequence data to predict structural motifs. A sliding-window data augmentation technique is used on the CB513 dataset to expand the training samples. The transformer shows strong ability to generalize across variable-length sequences while effectively capturing both local and long-range residue interactions.
- Abstract(参考訳): アミノ酸配列からαヘリックス、βシート、コイルなどのタンパク質二次構造を予測することは、タンパク質の機能を理解するのに不可欠である。
本研究では,タンパク質配列データに注意機構を適用し,構造モチーフを予測するトランスフォーマーモデルを提案する。
CB513データセットにスライディングウインドウデータ拡張技術を用いてトレーニングサンプルを拡張する。
変圧器は、局所および長距離の残余相互作用を効果的に捉えながら、可変長列をまたいで一般化する強い能力を示す。
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