論文の概要: Information-driven Fusion of Pathology Foundation Models for Enhanced Disease Characterization
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2512.11104v1
- Date: Thu, 11 Dec 2025 20:38:03 GMT
- ステータス: 翻訳完了
- システム内更新日: 2025-12-15 15:48:11.565227
- Title: Information-driven Fusion of Pathology Foundation Models for Enhanced Disease Characterization
- Title(参考訳): 病原性評価のための情報駆動型病態基盤モデルの融合
- Authors: Brennan Flannery, Thomas DeSilvio, Jane Nguyen, Satish E. Viswanath,
- Abstract要約: ファンデーションモデル(FM)は、様々な病理タスクにおいて強いパフォーマンスを示している。
本稿では,複数のFMを統一表現に統合するための情報駆動型インテリジェント融合戦略を提案する。
本研究は,病的FMのインテリジェントな相関誘導融合により,コンパクトなタスク調整表現が得られることを示唆する。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 0.26249027950824505
- License: http://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
- Abstract: Foundation models (FMs) have demonstrated strong performance across diverse pathology tasks. While there are similarities in the pre-training objectives of FMs, there is still limited understanding of their complementarity, redundancy in embedding spaces, or biological interpretation of features. In this study, we propose an information-driven, intelligent fusion strategy for integrating multiple pathology FMs into a unified representation and systematically evaluate its performance for cancer grading and staging across three distinct diseases. Diagnostic H&E whole-slide images from kidney (519 slides), prostate (490 slides), and rectal (200 slides) cancers were dichotomized into low versus high grade or stage. Both tile-level FMs (Conch v1.5, MUSK, Virchow2, H-Optimus1, Prov-Gigapath) and slide-level FMs (TITAN, CHIEF, MADELEINE) were considered to train downstream classifiers. We then evaluated three FM fusion schemes at both tile and slide levels: majority-vote ensembling, naive feature concatenation, and intelligent fusion based on correlation-guided pruning of redundant features. Under patient-stratified cross-validation with hold-out testing, intelligent fusion of tile-level embeddings yielded consistent gains in classification performance across all three cancers compared with the best single FMs and naive fusion. Global similarity metrics revealed substantial alignment of FM embedding spaces, contrasted by lower local neighborhood agreement, indicating complementary fine-grained information across FMs. Attention maps showed that intelligent fusion yielded concentrated attention on tumor regions while reducing spurious focus on benign regions. Our findings suggest that intelligent, correlation-guided fusion of pathology FMs can yield compact, task-tailored representations that enhance both predictive performance and interpretability in downstream computational pathology tasks.
- Abstract(参考訳): ファンデーションモデル(FM)は、様々な病理タスクにおいて強いパフォーマンスを示している。
FMの事前学習目的には類似点があるが、相補性、埋め込み空間の冗長性、特徴の生物学的解釈についてはまだ理解が限られている。
本研究では,複数の病理組織FMを統一表現に統合する情報駆動型インテリジェントフュージョン戦略を提案し,その性能を3つの異なる疾患にまたがって評価した。
腎(519スライド),前立腺(490スライド),直腸(200スライド)癌から得られたH&E画像は,低次,高次,高次に二色化した。
タイルレベルFM(Conch v1.5, MUSK, Virchow2, H-Optimus1, Prov-Gigapath)とスライドレベルFM(TITAN, CHIEF, MADELEINE)の両方が下流分類器の訓練に用いられた。
次に, 余剰特徴の相関誘導プルーニングに基づいて, 3種類のFM融合方式をタイルレベルとスライドレベルの両方で評価した。
患者層別クロスバリデーションとホールドアウトテストでは, タイルレベル埋め込みのインテリジェントな融合は, 最高の単一FMやナイーブ融合と比較して, 3つのがんの分類性能において一貫した上昇を示した。
グローバルな類似度測定により,FMの埋め込み空間の相当なアライメントが明らかとなった。
注意図では,知能融合は腫瘍部位への注意を惹起し,良性部位への急激な焦点を減少させた。
以上の結果から,病的FMのインテリジェントな相関誘導による融合により,下流の計算病理学的タスクにおいて,予測性能と解釈可能性の両方を高めるコンパクトなタスク調整表現が得られることが示唆された。
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