論文の概要: MONET -- Virtual Cell Painting of Brightfield Images and Time Lapses Using Reference Consistent Diffusion
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2512.11928v1
- Date: Fri, 12 Dec 2025 01:01:34 GMT
- ステータス: 翻訳完了
- システム内更新日: 2025-12-16 17:54:56.030294
- Title: MONET -- Virtual Cell Painting of Brightfield Images and Time Lapses Using Reference Consistent Diffusion
- Title(参考訳): MONET -- 参照整合拡散を用いたブライトフィールド画像とタイムラプスの仮想セルペイント
- Authors: Alexander Peysakhovich, William Berman, Joseph Rufo, Felix Wong, Maxwell Z. Wilson,
- Abstract要約: 細胞絵画は、細胞形態の人間解釈可能な画像を作成するための一般的な技法である。
細胞塗料には2つの大きな問題がある:それは労働集約的で、化学的な固定が必要である。
我々は、大きなデータセット上で拡散モデルをトレーニングし、明るいフィールド画像からセルペイントチャネルを予測する。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 37.62160903348546
- License: http://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
- Abstract: Cell painting is a popular technique for creating human-interpretable, high-contrast images of cell morphology. There are two major issues with cell paint: (1) it is labor-intensive and (2) it requires chemical fixation, making the study of cell dynamics impossible. We train a diffusion model (Morphological Observation Neural Enhancement Tool, or MONET) on a large dataset to predict cell paint channels from brightfield images. We show that model quality improves with scale. The model uses a consistency architecture to generate time-lapse videos, despite the impossibility of obtaining cell paint video training data. In addition, we show that this architecture enables a form of in-context learning, allowing the model to partially transfer to out-of-distribution cell lines and imaging protocols. Virtual cell painting is not intended to replace physical cell painting completely, but to act as a complementary tool enabling novel workflows in biological research.
- Abstract(参考訳): 細胞絵画は、細胞形態の人間の解釈可能な高コントラスト画像を作成するための一般的な技法である。
細胞塗料には2つの大きな問題がある: (1) 労働集約的であり、(2) 化学固定を必要とするため、細胞動態の研究は不可能である。
我々は,大規模なデータセット上に拡散モデル(Morphological Observation Neural Enhancement Tool, MONET)をトレーニングし,明るい視野画像からセルペイントチャネルを予測する。
モデルの品質はスケールで向上します。
このモデルは、セルペイントビデオトレーニングデータを得ることができないにもかかわらず、一貫性のあるアーキテクチャを使ってタイムラプスビデオを生成する。
さらに,本アーキテクチャはコンテキスト内学習を可能とし,そのモデルが配布外セル線や画像プロトコルに部分的に転送可能であることを示す。
仮想細胞絵画は、物理的細胞絵画を完全に置き換えることではなく、生物学的研究において新しいワークフローを可能にする補完的なツールとして機能することを目的としている。
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