論文の概要: Quantum Encoding of Three-Dimensional Ligand Poses for Exhaustive Configuration Enumeration

• arxiv url: http://arxiv.org/abs/2512.12573v1
• Date: Sun, 14 Dec 2025 06:39:21 GMT
• ステータス: 翻訳完了
• システム内更新日: 2025-12-16 17:54:56.321057
• Title: Quantum Encoding of Three-Dimensional Ligand Poses for Exhaustive Configuration Enumeration
• Title（参考訳）: 被曝構成列挙のための3次元リガンド電位の量子符号化
• Authors: Pei-Kun Yang,
• Abstract要約: 量子ネイティブな定式化は、単一の量子状態内で空間構成の完全なアンサンブルを生成する。 このフレームワークは量子加速仮想スクリーニングのためのスケーラブルな基盤を提供する。
• 参考スコア（独自算出の注目度）: 0.0
• License: http://arxiv.org/licenses/nonexclusive-distrib/1.0/
• Abstract: Classical molecular docking is fundamentally constrained by the combinatorial growth of ligand translational and rotational degrees of freedom, rendering exhaustive pose enumeration infeasible on classical hardware. This work introduces a quantum-native formulation that encodes ligand occupancy on discretized three-dimensional grids and coherently generates the full ensemble of spatial configurations within a single quantum state. Multi-step translations and rotational transformations are controlled by ancillary qubits, enabling all symmetry-related configurations to be activated simultaneously. This framework provides a scalable foundation for quantum-accelerated virtual screening and is amenable to integration with quantum scoring approaches as quantum hardware continues to advance.
• Abstract（参考訳）: 古典的な分子ドッキングは、リガンド翻訳と回転自由度の組合せによって基本的に制限され、古典的なハードウェアでは不可能な徹底的なポーズ列挙が実現される。 この研究は、離散化された3次元格子上の配位子占有を符号化し、1つの量子状態内の空間構成の完全なアンサンブルをコヒーレントに生成する量子ネイティブな定式化を導入する。 多段階の翻訳と回転変換は、全ての対称性に関連した構成を同時に活性化することができるように、補助量子ビットによって制御される。 このフレームワークは、量子加速仮想スクリーニングのためのスケーラブルな基盤を提供し、量子ハードウェアの進歩に伴って量子スコアリングアプローチとの統合が可能である。

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