論文の概要: Clinical Knowledge Graph Construction and Evaluation with Multi-LLMs via Retrieval-Augmented Generation
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2601.01844v1
- Date: Mon, 05 Jan 2026 07:16:29 GMT
- ステータス: 翻訳完了
- システム内更新日: 2026-01-06 16:25:22.835395
- Title: Clinical Knowledge Graph Construction and Evaluation with Multi-LLMs via Retrieval-Augmented Generation
- Title(参考訳): Retrieval-Augmented Generationによる多LLMの臨床知識グラフの構築と評価
- Authors: Udiptaman Das, Krishnasai B. Atmakuri, Duy Ho, Chi Lee, Yugyung Lee,
- Abstract要約: 大規模言語モデル(LLM)は、構造化されていない臨床物語から知識グラフを構築する新しい機会を提供する。
既存のアプローチは、しばしば構造化された入力に依存し、事実の正確さと意味的な一貫性の堅牢な検証が欠如している。
マルチエージェントプロンプトとスキーマ制約付き検索・拡張生成戦略を用いた臨床用KG構築のためのエンドツーエンドフレームワークを提案する。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 1.155620308725562
- License: http://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
- Abstract: Large language models (LLMs) offer new opportunities for constructing knowledge graphs (KGs) from unstructured clinical narratives. However, existing approaches often rely on structured inputs and lack robust validation of factual accuracy and semantic consistency, limitations that are especially problematic in oncology. We introduce an end-to-end framework for clinical KG construction and evaluation directly from free text using multi-agent prompting and a schema-constrained Retrieval-Augmented Generation (KG-RAG) strategy. Our pipeline integrates (1) prompt-driven entity, attribute, and relation extraction; (2) entropy-based uncertainty scoring; (3) ontology-aligned RDF/OWL schema generation; and (4) multi-LLM consensus validation for hallucination detection and semantic refinement. Beyond static graph construction, the framework supports continuous refinement and self-supervised evaluation, enabling iterative improvement of graph quality. Applied to two oncology cohorts (PDAC and BRCA), our method produces interpretable, SPARQL-compatible, and clinically grounded knowledge graphs without relying on gold-standard annotations. Experimental results demonstrate consistent gains in precision, relevance, and ontology compliance over baseline methods.
- Abstract(参考訳): 大言語モデル(LLM)は、構造化されていない臨床物語から知識グラフ(KG)を構築する新しい機会を提供する。
しかし、既存のアプローチは、しばしば構造化された入力に依存し、オンコロジーにおいて特に問題となる、事実の正確さと意味的一貫性の堅牢な検証を欠いている。
本稿では, マルチエージェントプロンプトとスキーマ制約付き検索・拡張生成(KG-RAG)戦略を用いて, フリーテキストから直接, 臨床用KGの構築と評価を行うためのエンドツーエンドフレームワークを提案する。
本パイプラインは,(1)プロンプト駆動型エンティティ,属性,関係抽出,(2)エントロピーに基づく不確実性スコアリング,(3)オントロジー対応RDF/OWLスキーマ生成,(4)幻覚検出とセマンティックリファインメントのためのマルチLLMコンセンサス検証を統合する。
静的グラフ構築以外にも、このフレームワークは継続的改善と自己教師付き評価をサポートし、グラフ品質の反復的な改善を可能にしている。
2つのオンコロジーコホート (PDAC, BRCA) に適用し, 金標準アノテーションを頼らずに解釈可能, SPARQL互換, 臨床基礎知識グラフを生成する。
実験の結果,ベースライン法よりも精度,妥当性,オントロジーの順守が一貫した向上を示した。
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