論文の概要: IMSAHLO: Integrating Multi-Scale Attention and Hybrid Loss Optimization Framework for Robust Neuronal Brain Cell Segmentation
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2601.11645v1
- Date: Wed, 14 Jan 2026 23:43:33 GMT
- ステータス: 翻訳完了
- システム内更新日: 2026-01-21 22:47:22.246954
- Title: IMSAHLO: Integrating Multi-Scale Attention and Hybrid Loss Optimization Framework for Robust Neuronal Brain Cell Segmentation
- Title(参考訳): IMSAHLO:ロバスト脳細胞分離のためのマルチスケール注意とハイブリッドロス最適化フレームワーク
- Authors: Ujjwal Jain, Oshin Misra, Roshni Chakraborty, Mahua Bhattacharya,
- Abstract要約: 我々は,頑健で適応的な神経細胞分割のための新しいディープラーニングフレームワーク,IMSAHLOを提案する。
本フレームワークは81.4%の精度,マクロF1スコア82.7%の精度,マイクロF1スコア83.3%の精度,難密でスパースなケースでは99.5%の精度を実現している。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 0.6999740786886535
- License: http://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
- Abstract: Accurate segmentation of neuronal cells in fluorescence microscopy is a fundamental task for quantitative analysis in computational neuroscience. However, it is significantly impeded by challenges such as the coexistence of densely packed and sparsely distributed cells, complex overlapping morphologies, and severe class imbalance. Conventional deep learning models often fail to preserve fine topological details or accurately delineate boundaries under these conditions. To address these limitations, we propose a novel deep learning framework, IMSAHLO (Integrating Multi-Scale Attention and Hybrid Loss Optimization), for robust and adaptive neuronal segmentation. The core of our model features Multi-Scale Dense Blocks (MSDBs) to capture features at various receptive fields, effectively handling variations in cell density, and a Hierarchical Attention (HA) mechanism that adaptively focuses on salient morphological features to preserve Region of Interest (ROI) boundary details. Furthermore, we introduce a novel hybrid loss function synergistically combining Tversky and Focal loss to combat class imbalance, alongside a topology-aware Centerline Dice (clDice) loss and a Contour-Weighted Boundary loss to ensure topological continuity and precise separation of adjacent cells. Large-scale experiments on the public Fluorescent Neuronal Cells (FNC) dataset demonstrate that our framework outperforms state-of-the-art architectures, achieving precision of 81.4%, macro F1 score of 82.7%, micro F1 score of 83.3%, and balanced accuracy of 99.5% on difficult dense and sparse cases. Ablation studies validate the synergistic benefits of multi-scale attention and hybrid loss terms. This work establishes a foundation for generalizable segmentation models applicable to a wide range of biomedical imaging modalities, pushing AI-assisted analysis toward high-throughput neurobiological pipelines.
- Abstract(参考訳): 蛍光顕微鏡における神経細胞の正確なセグメンテーションは、計算神経科学における定量的解析の基本的な課題である。
しかし, 密充填・疎分散セルの共存, 複雑な重複形態, 重度のクラス不均衡など, 課題によって著しく阻害されている。
従来のディープラーニングモデルは、詳細なトポロジカルな詳細を保存することや、これらの条件下で境界を正確に記述することに失敗することが多い。
これらの制約に対処するため、我々は、堅牢で適応的なニューロン分割のための新しいディープラーニングフレームワーク、IMSAHLO(Integrating Multi-Scale Attention and Hybrid Loss Optimization)を提案する。
我々のモデルの中核は、様々な受容領域における特徴を捉え、細胞密度の変動を効果的に扱えるマルチスケール・センス・ブロック(MSDB)と、関心領域(ROI)境界の詳細を保持するために適応的に健全な形態的特徴に焦点をあてる階層的注意(HA)機構である。
さらに,Tversky と Focal の損失を戦闘クラス不均衡に相乗的に組み合わせた新たなハイブリッド・ロス関数を導入し,トポロジカル連続性と隣接細胞の正確な分離を確保するために,トポロジカル・アウェア・センターライン・ダイス(clDice)損失とコントラル・バウンダリ・ロス(Contour-Weighted boundary loss)を併用した。
一般の蛍光細胞(FNC)データセットによる大規模な実験により、我々のフレームワークは最先端のアーキテクチャよりも優れており、81.4%の精度、マクロF1スコア82.7%のスコア、マイクロF1スコア83.3%のスコア、厳密でスパースなケースでは99.5%の精度が達成されている。
アブレーション研究は、マルチスケールの注意とハイブリッド損失項の相乗効果を検証する。
この研究は、幅広い生体画像モダリティに適用可能な一般化可能なセグメンテーションモデルの基礎を確立し、AI支援分析を高スループットの神経生物学パイプラインにプッシュする。
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