論文の概要: Karhunen-Loève Expansion-Based Residual Anomaly Map for Resource-Efficient Glioma MRI Segmentation
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2601.11833v1
- Date: Fri, 16 Jan 2026 23:48:40 GMT
- ステータス: 翻訳完了
- システム内更新日: 2026-01-21 22:47:22.338127
- Title: Karhunen-Loève Expansion-Based Residual Anomaly Map for Resource-Efficient Glioma MRI Segmentation
- Title(参考訳): 資源効率の良いグリオーマMRI分割のためのKarhunen-Loève拡張型残留異常マップ
- Authors: Anthony Hur,
- Abstract要約: ディープラーニングは、現在、脳腫瘍セグメンテーションの最先端技術である。
最先端のモデルでは、何千ものトレーニングケースと膨大な計算能力を使用し、どちらかが制限された場合、パフォーマンスが急激に低下する。
本研究は,zスコア正規化MRIボリュームのダウンサンプリングにおける特徴抽出のステップを実装した。
後処理のDiceスコアは0.929(WT)、0.856(TC)、0.821(ET)でHD95距離は2.93、6.78、そして10.35ボクセルである。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 0.0
- License: http://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
- Abstract: Accurate segmentation of brain tumors is essential for clinical diagnosis and treatment planning. Deep learning is currently the state-of-the-art for brain tumor segmentation, yet it requires either large datasets or extensive computational resources that are inaccessible in most areas. This makes the problem increasingly difficult: state-of-the-art models use thousands of training cases and vast computational power, where performance drops sharply when either is limited. The top performer in the Brats GLI 2023 competition relied on supercomputers trained on over 92,000 augmented MRI scans using an AMD EPYC 7402 CPU, six NVIDIA RTX 6000 GPUs (48GB VRAM each), and 1024GB of RAM over multiple weeks. To address this, the Karhunen--Loève Expansion (KLE) was implemented as a feature extraction step on downsampled, z-score normalized MRI volumes. Each 240$\times$240$\times$155 multi-modal scan is reduced to four $48^3$ channels and compressed into 32 KL coefficients. The resulting approximate reconstruction enables a residual-based anomaly map, which is upsampled and added as a fifth channel to a compact 3D U-Net. All experiments were run on a consumer workstation (AMD Ryzen 5 7600X CPU, RTX 4060Ti (8GB VRAM), and 64GB RAM while using far fewer training cases. This model achieves post-processed Dice scores of 0.929 (WT), 0.856 (TC), and 0.821 (ET), with HD95 distances of 2.93, 6.78, and 10.35 voxels. These results are significantly better than the winning BraTS 2023 methodology for HD95 distances and WT dice scores. This demonstrates that a KLE-based residual anomaly map can dramatically reduce computational cost and data requirements while retaining state-of-the-art performance.
- Abstract(参考訳): 脳腫瘍の正確なセグメンテーションは臨床診断と治療計画に不可欠である。
ディープラーニングは、現在、脳腫瘍セグメンテーションの最先端技術であるが、ほとんどの領域ではアクセスできない大規模なデータセットまたは広範な計算資源を必要とする。
最先端のモデルでは、何千ものトレーニングケースと膨大な計算能力を使用し、どちらかが制限された場合、パフォーマンスが急激に低下する。
Brats GLI 2023コンペティションのトップパフォーマーは、AMD EPYC 7402 CPU、NVIDIA RTX 6000 GPU(それぞれ48GB VRAM)、6週間にわたって1024GBのRAMを使用して、92,000以上のMRIスキャンをトレーニングしたスーパーコンピュータに頼っていた。
これを解決するため、KLE(Karhunen-Loève Expansion)は、低サンプリングのzスコア正規化MRIボリュームの特徴抽出ステップとして実装された。
240$\times$240$\times$155マルチモーダルスキャンは4つの48^3$チャネルに縮小され、32KL係数に圧縮される。
その結果、近似的な再構成により、コンパクトな3D U-Netに5番目のチャネルとしてアップサンプリングされ追加される残差ベースの異常マップが実現される。
全ての実験はコンシューマー向けワークステーション(AMD Ryzen 5 7600X CPU、RTX 4060Ti(8GB VRAM)、64GB RAMで実行され、トレーニングケースははるかに少ない。
このモデルは、HD95距離の0.929(WT)、0.856(TC)、0.821(ET)で、HD95距離は2.93、6.78、そして10.35ボクセルである。
これらの結果は、HD95距離とWTダイススコアで勝利したBraTS 2023法よりも有意に優れている。
このことは、KLEベースの残差異常マップが、最先端性能を維持しながら、計算コストとデータ要求を大幅に削減できることを示している。
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