論文の概要: An efficient heuristic for geometric analysis of cell deformations
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2601.12928v1
- Date: Mon, 19 Jan 2026 10:30:52 GMT
- ステータス: 翻訳完了
- システム内更新日: 2026-01-21 22:47:22.864279
- Title: An efficient heuristic for geometric analysis of cell deformations
- Title(参考訳): 細胞変形の幾何学的解析のための効率的なヒューリスティック
- Authors: Yaima Paz Soto, Silena Herold Garcia, Ximo Gual-Arnau, Antoni Jaume-i-Capó, Manuel González-Hidalgo,
- Abstract要約: シックル細胞病は赤血球を病気の形にし、血流の移動に影響を与え、酸素の放出を減少させる。
グローバルな普及率が高く、特に資源に制限のある地域では医療システムに大きな負担がかかる。
近年の研究では、赤血球の表現と分類法が提案されている。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 2.424924394614033
- License: http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/
- Abstract: Sickle cell disease causes erythrocytes to become sickle-shaped, affecting their movement in the bloodstream and reducing oxygen delivery. It has a high global prevalence and places a significant burden on healthcare systems, especially in resource-limited regions. Automated classification of sickle cells in blood images is crucial, allowing the specialist to reduce the effort required and avoid errors when quantifying the deformed cells and assessing the severity of a crisis. Recent studies have proposed various erythrocyte representation and classification methods. Since classification depends solely on cell shape, a suitable approach models erythrocytes as closed planar curves in shape space. This approach employs elastic distances between shapes, which are invariant under rotations, translations, scaling, and reparameterizations, ensuring consistent distance measurements regardless of the curves' position, starting point, or traversal speed. While previous methods exploiting shape space distances had achieved high accuracy, we refined the model by considering the geometric characteristics of healthy and sickled erythrocytes. Our method proposes (1) to employ a fixed parameterization based on the major axis of each cell to compute distances and (2) to align each cell with two templates using this parameterization before computing distances. Aligning shapes to templates before distance computation, a concept successfully applied in areas such as molecular dynamics, and using a fixed parameterization, instead of minimizing distances across all possible parameterizations, simplifies calculations. This strategy achieves 96.03\% accuracy rate in both supervised classification and unsupervised clustering. Our method ensures efficient erythrocyte classification, maintaining or improving accuracy over shape space models while significantly reducing computational costs.
- Abstract(参考訳): シックル細胞病は赤血球を病気の形にし、血流の移動に影響を与え、酸素の供給を減少させる。
グローバルな普及率が高く、特に資源に制限のある地域では医療システムに大きな負担がかかる。
血液画像中の病原細胞の自動分類が不可欠であり、変形した細胞を定量化し、危機の深刻度を評価する際に、専門家は必要な労力を削減し、エラーを避けることができる。
近年の研究では、赤血球の表現と分類法が提案されている。
分類は細胞の形態にのみ依存するため、適切なアプローチは赤血球を形状空間における閉じた平面曲線としてモデル化する。
このアプローチでは、回転、翻訳、スケーリング、再パラメータ化の下で不変な形状間の弾性距離を導入し、曲線の位置、出発点、走行速度に関わらず一貫した距離の測定を確実にする。
従来, 形状空間距離を利用した手法は精度が高かったが, 健康な赤血球や病原性赤血球の幾何学的特徴を考慮し, モデルの改良を行った。
提案手法では,(1)各セルの主軸に基づく固定パラメータ化を用いて距離を計算し,(2)このパラメータ化を用いて距離を計算する。
距離計算に先立ってテンプレートに形状を調整し、分子動力学などの分野に適用し、固定パラメータ化を使用するという概念は、可能な全てのパラメータ化から距離を最小化するのではなく、計算を単純化する。
この戦略は、教師なし分類と教師なしクラスタリングの両方において96.03\%の精度を達成する。
本手法は, 計算コストを大幅に削減しつつ, 形状空間モデルよりも効率的な赤血球の分類, 維持, 精度の向上を図る。
関連論文リスト
- Departures: Distributional Transport for Single-Cell Perturbation Prediction with Neural Schrödinger Bridges [51.83259180910313]
遺伝子機能解析における大きなボトルネックは、単細胞データの未成熟の性質である。
我々は、SB(Schrdinger Bridge)を近似して、単セル摂動データに対処する。
本モデルは,異種単一セル応答を効果的に捉え,最先端の性能を実現する。
論文 参考訳(メタデータ) (2025-11-17T08:27:13Z) - Linearized Optimal Transport for Analysis of High-Dimensional Point-Cloud and Single-Cell Data [45.87606039212519]
シングルセル技術は、細胞の高次元点雲を生成する。
各患者は単純なベクトルではなく不規則な点雲で表される。
線形最適輸送フレームワークを用いて不規則点雲を固定次元ユークリッド空間に埋め込む。
論文 参考訳(メタデータ) (2025-10-24T21:33:12Z) - Inferring stochastic dynamics with growth from cross-sectional data [3.3748750222488657]
本稿では,成長を伴うダイナミックスとしてモデル化された生物学的プロセスの課題に対処する,新しい確率フロー推定手法を提案する。
フォッカー・プランク方程式のラグランジアン定式化を利用して, 本手法は内在雑音や成長からドリフトを正確に解離する。
論文 参考訳(メタデータ) (2025-05-19T14:51:47Z) - A kinetic approach to consensus-based segmentation of biomedical images [39.58317527488534]
バイオメディカルセグメンテーション問題に有界信頼度コンセンサスモデルの運動バージョンを適用した。
システムの長時間の挙動は、代理のフォッカー・プランク法(英語版)の助けを借りて計算される。
2次元グレースケール画像の関連集合に対して導入されたセグメンテーション距離を最小化する。
論文 参考訳(メタデータ) (2022-11-08T09:54:34Z) - Corneal endothelium assessment in specular microscopy images with Fuchs'
dystrophy via deep regression of signed distance maps [48.498376125522114]
本稿では,UNetをベースとしたセグメンテーション手法を提案する。
これは、フックスのジストロフィーの全度にわたって、信頼できるCE形態計測と腸骨同定を実現する。
論文 参考訳(メタデータ) (2022-10-13T15:34:20Z) - Error-Correcting Neural Networks for Two-Dimensional Curvature
Computation in the Level-Set Method [0.0]
本稿では,2次元曲率をレベルセット法で近似するための誤差ニューラルモデルに基づく手法を提案する。
我々の主な貢献は、需要に応じて機械学習操作を可能にする数値スキームに依存する、再設計されたハイブリッド・ソルバである。
論文 参考訳(メタデータ) (2022-01-22T05:14:40Z) - Local Morphometry of Closed, Implicit Surfaces [1.0499611180329804]
本稿では,ガウスのぼやけた2値像のゼロ交叉として,高精度な局所形状計測のための高速で簡単な埋め込み手法を提案する。
平均曲率の決定係数は、符号付き距離変換により93.8%から、提案手法により100%に向上する。
符号付き距離変換では使用不可能なEuler-Poincare特性を98%の精度で改善する。
論文 参考訳(メタデータ) (2021-07-29T18:10:10Z) - Constrained Multi-shape Evolution for Overlapping Cytoplasm Segmentation [49.992392231966015]
本稿では,制約型多形進化という,新しい,効果的形状の先進的アプローチを提案する。
クランプ内のすべての重なり合う細胞質を同時に分割し、モデル化された形状によって誘導される各細胞質の形状を共同で進化させる。
形状進化においては, 局所形状前兆だけでなく, 大域形状前兆も導入することにより, セグメンテーションの強度不足を補う。
論文 参考訳(メタデータ) (2020-04-08T09:08:07Z)
関連論文リストは本サイト内にある論文のタイトル・アブストラクトから自動的に作成しています。
指定された論文の情報です。
本サイトの運営者は本サイト(すべての情報・翻訳含む)の品質を保証せず、本サイト(すべての情報・翻訳含む)を使用して発生したあらゆる結果について一切の責任を負いません。