論文の概要: MTFlow: Time-Conditioned Flow Matching for Microtubule Segmentation in Noisy Microscopy Images
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2601.14841v1
- Date: Wed, 21 Jan 2026 10:14:50 GMT
- ステータス: 翻訳完了
- システム内更新日: 2026-01-22 21:27:50.326748
- Title: MTFlow: Time-Conditioned Flow Matching for Microtubule Segmentation in Noisy Microscopy Images
- Title(参考訳): MTFlow:ノイズ顕微鏡画像における微小管分割のための時間変化フローマッチング
- Authors: Sidi Mohamed Sid El Moctar, Achraf Ait Laydi, Yousef El Mourabit, Hélène Bouvrais,
- Abstract要約: MTFlowはマイクロチューブセグメンテーションのための時間条件付きフローマッチングモデルである。
ノイズマスクを基底真理に向けて反復的に輸送するベクトル場を学ぶ。
最先端のモデルに匹敵する、競争力のあるセグメンテーションの精度を実現する。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 0.29165586612027233
- License: http://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
- Abstract: Microtubules are cytoskeletal filaments that play essential roles in many cellular processes and are key therapeutic targets in several diseases. Accurate segmentation of microtubule networks is critical for studying their organization and dynamics but remains challenging due to filament curvature, dense crossings, and image noise. We present MTFlow, a novel time-conditioned flow-matching model for microtubule segmentation. Unlike conventional U-Net variants that predict masks in a single pass, MTFlow learns vector fields that iteratively transport noisy masks toward the ground truth, enabling interpretable, trajectory-based refinement. Our architecture combines a U-Net backbone with temporal embeddings, allowing the model to capture the dynamics of uncertainty resolution along filament boundaries. We trained and evaluated MTFlow on synthetic and real microtubule datasets and assessed its generalization capability on public biomedical datasets of curvilinear structures such as retinal blood vessels and nerves. MTFlow achieves competitive segmentation accuracy comparable to state-of-the-art models, offering a powerful and time-efficient tool for filamentous structure analysis with more precise annotations than manual or semi-automatic approaches.
- Abstract(参考訳): 微小管は細胞骨格のフィラメントであり、多くの細胞プロセスにおいて重要な役割を担い、いくつかの疾患において重要な治療標的である。
マイクロチューブネットワークの正確なセグメンテーションは、組織や力学を研究する上で重要であるが、フィラメントの曲率、密度の高い交差、画像ノイズのために依然として困難である。
本稿では,マイクロチューブセグメンテーションのための時間条件付きフローマッチングモデルMTFlowを提案する。
シングルパスのマスクを予測する従来のU-Netの変種とは異なり、MTFlowはノイズマスクを基底真実に向けて繰り返し輸送するベクトル場を学習し、解釈可能な軌道ベースの改良を可能にする。
我々のアーキテクチャは、U-Netバックボーンと時間埋め込みを組み合わせることで、フィラメント境界に沿って不確実性解決のダイナミクスを捉えることができる。
MTFlowを人工および実際の微小管のデータセットで訓練,評価し,網膜血管や神経などの血管構造の公開生体医学的データセットでその一般化能力を評価した。
MTFlowは最先端のモデルに匹敵する競合セグメンテーションの精度を実現し、手動や半自動のアプローチよりも正確なアノテーションでフィラメント構造解析を行うための強力で時間効率のツールを提供する。
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