論文の概要: Toxicity Assessment in Preclinical Histopathology via Class-Aware Mahalanobis Distance for Known and Novel Anomalies
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2602.02124v1
- Date: Mon, 02 Feb 2026 14:07:33 GMT
- ステータス: 翻訳完了
- システム内更新日: 2026-02-03 19:28:34.190272
- Title: Toxicity Assessment in Preclinical Histopathology via Class-Aware Mahalanobis Distance for Known and Novel Anomalies
- Title(参考訳): 学級別マハラノビス距離による前臨床病理組織学の毒性評価
- Authors: Olga Graf, Dhrupal Patel, Peter Groß, Charlotte Lempp, Matthias Hein, Fabian Heinemann,
- Abstract要約: 薬物による毒性は、先天的な発達と初期の臨床試験の失敗の主因である。
組織学的全スライディング画像(WSI)のためのAIベースの異常検出フレームワークを,毒性研究から紹介した。
このシステムは、トレーニングデータが利用可能である健康な組織と既知の病理(アナマリー)を特定する。
アウト・オブ・ディストリビューション(OOD:out-of-distribution)の所見として、トレーニングデータなしで希少な病理を検出できる。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 10.430313289285158
- License: http://arxiv.org/licenses/nonexclusive-distrib/1.0/
- Abstract: Drug-induced toxicity remains a leading cause of failure in preclinical development and early clinical trials. Detecting adverse effects at an early stage is critical to reduce attrition and accelerate the development of safe medicines. Histopathological evaluation remains the gold standard for toxicity assessment, but it relies heavily on expert pathologists, creating a bottleneck for large-scale screening. To address this challenge, we introduce an AI-based anomaly detection framework for histopathological whole-slide images (WSIs) in rodent livers from toxicology studies. The system identifies healthy tissue and known pathologies (anomalies) for which training data is available. In addition, it can detect rare pathologies without training data as out-of-distribution (OOD) findings. We generate a novel dataset of pixelwise annotations of healthy tissue and known pathologies and use this data to fine-tune a pre-trained Vision Transformer (DINOv2) via Low-Rank Adaptation (LoRA) in order to do tissue segmentation. Finally, we extract features for OOD detection using the Mahalanobis distance. To better account for class-dependent variability in histological data, we propose the use of class-specific thresholds. We optimize the thresholds using the mean of the false negative and false positive rates, resulting in only 0.16\% of pathological tissue classified as healthy and 0.35\% of healthy tissue classified as pathological. Applied to mouse liver WSIs with known toxicological findings, the framework accurately detects anomalies, including rare OOD morphologies. This work demonstrates the potential of AI-driven histopathology to support preclinical workflows, reduce late-stage failures, and improve efficiency in drug development.
- Abstract(参考訳): 薬物による毒性は、先天的な発達と初期の臨床試験の失敗の主な原因である。
早期の副作用の検出は、有害度を減らし、安全な医薬品の開発を促進するために重要である。
病理組織学的評価は、毒性評価の金の基準であり続けているが、専門家の病理学者に大きく依存しており、大規模検診のボトルネックとなっている。
この課題に対処するために,病原性肝における病理組織学的全スライディング画像(WSI)に対するAIベースの異常検出フレームワークを導入する。
このシステムは、トレーニングデータが利用可能である健康な組織と既知の病理(アナマリー)を特定する。
さらに、アウト・オブ・ディストリビューション(OOD)の所見として、トレーニングデータなしで希少な病理を検出できる。
我々は、健康な組織と既知の病理のピクセルワイドアノテーションのデータセットを作成し、このデータを用いて、組織セグメンテーションを行うために、Low-Rank Adaptation (LoRA)を介して、トレーニング済みのVision Transformer (DINOv2)を微調整する。
最後に,マハラノビス距離を用いたOOD検出の特徴を抽出する。
組織学的データにおけるクラス依存的変動をよりよく考慮するために,クラス依存しきい値の使用を提案する。
その結果,病理組織は0.16 %,病理組織は0.35 %,病理組織は0.35 %であった。
マウス肝臓WSIに既知の毒性所見を応用し、まれなOOD形態を含む異常を正確に検出する。
この研究は、前臨床ワークフローをサポートし、後期の失敗を減らし、薬物開発における効率を向上させるために、AI駆動の病理学の可能性を示す。
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