論文の概要: Forecasting Antimicrobial Resistance Trends Using Machine Learning on WHO GLASS Surveillance Data: A Retrieval-Augmented Generation Approach for Policy Decision Support
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2602.22673v1
- Date: Thu, 26 Feb 2026 06:45:08 GMT
- ステータス: 翻訳完了
- システム内更新日: 2026-02-27 18:41:22.55945
- Title: Forecasting Antimicrobial Resistance Trends Using Machine Learning on WHO GLASS Surveillance Data: A Retrieval-Augmented Generation Approach for Policy Decision Support
- Title(参考訳): WHO GLASSサーベイランスデータを用いた機械学習による抗菌抵抗の予測:政策決定支援のための検索・拡張された生成手法
- Authors: Md Tanvir Hasan Turja,
- Abstract要約: 抗微生物抵抗性(AMR)は、2050年までに年間1000万人が死亡すると予想される世界的な危機である。
本稿では,AMRトレンド予測とエビデンスに基づく政策決定支援のための2成分フレームワークを提案する。
XGBoostは7.07%のMAEと0.854のR-squaredで最高性能を達成し、ナイーブベースラインを83.1%上回った。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 0.0
- License: http://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
- Abstract: Antimicrobial resistance (AMR) is a growing global crisis projected to cause 10 million deaths per year by 2050. While the WHO Global Antimicrobial Resistance and Use Surveillance System (GLASS) provides standardized surveillance data across 44 countries, few studies have applied machine learning to forecast population-level resistance trends from this data. This paper presents a two-component framework for AMR trend forecasting and evidence-grounded policy decision support. We benchmark six models -- Naive, Linear Regression, Ridge Regression, XGBoost, LightGBM, and LSTM -- on 5,909 WHO GLASS observations across six WHO regions (2021-2023). XGBoost achieved the best performance with a test MAE of 7.07% and R-squared of 0.854, outperforming the naive baseline by 83.1%. Feature importance analysis identified the prior-year resistance rate as the dominant predictor (50.5% importance), while regional MAE ranged from 4.16% (European Region) to 10.14% (South-East Asia Region). We additionally implemented a Retrieval-Augmented Generation (RAG) pipeline combining a ChromaDB vector store of WHO policy documents with a locally deployed Phi-3 Mini language model, producing source-attributed, hallucination-constrained policy answers. Code and data are available at https://github.com/TanvirTurja
- Abstract(参考訳): 抗微生物抵抗性(AMR)は、2050年までに年間1000万人が死亡すると予想される世界的な危機である。
WHO Global Antimicrobial resistance and Use Surveillance System (GLASS)は44カ国で標準化された監視データを提供しているが、このデータから人口レベルの抵抗傾向を予測するために機械学習を適用した研究はほとんどない。
本稿では,AMRトレンド予測とエビデンスに基づく政策決定支援のための2成分フレームワークを提案する。
Naive、Linear Regression、Rook Regression、XGBoost、LightGBM、LSTMの6つのモデルを、WHOの6つのリージョン(2021-2023)で5,909 WHO GLASS観測でベンチマークしました。
XGBoostは7.07%のMAEと0.854のR-squaredで最高性能を達成し、ナイーブベースラインを83.1%上回った。
特徴的重要性分析では、前年の抵抗率が支配的な予測因子(50.5%)であるのに対し、地域MAEは4.16%(ヨーロッパ地域)から10.14%(東南アジア地域)まで変化している。
WHO政策文書のクロマDBベクターストアとローカルにデプロイされたPhi-3 Mini言語モデルを組み合わせた検索型拡張生成(RAG)パイプラインも実装した。
コードとデータはhttps://github.com/TanvirTurjaで公開されている。
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