論文の概要: CrossADR: enhancing adverse drug reactions prediction for combination pharmacotherapy with cross-layer feature integration and cross-level associative learning
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2603.15047v1
- Date: Mon, 16 Mar 2026 09:58:03 GMT
- ステータス: 翻訳完了
- システム内更新日: 2026-03-17 18:28:57.995922
- Title: CrossADR: enhancing adverse drug reactions prediction for combination pharmacotherapy with cross-layer feature integration and cross-level associative learning
- Title(参考訳): CrossADR:クロス層機能統合とクロスレベル連想学習を組み合わせた薬物療法における副作用予測の強化
- Authors: Y. Cheung,
- Abstract要約: 併用療法は相当な治療効果をもたらすが、有害薬物反応(ADR)のリスクを生じさせる。
ここでは,クロス層機能統合とクロスレベル連想学習による臓器レベルのADR予測のための階層的フレームワークであるCrossADRを提案する。
ゲート-残留フローグラフニューラルネットワークを組み込んで、マルチスケールの分子的特徴を融合させ、学習可能なADR埋め込み空間を利用して、15の臓器系にまたがる潜在生物学的相関を動的に捉える。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 0.0
- License: http://arxiv.org/licenses/nonexclusive-distrib/1.0/
- Abstract: Combination pharmacotherapy offers substantial therapeutic advantages but also poses substantial risks of adverse drug reactions (ADRs). The accurate prediction of ADRs with interpretable computational methods is crucial for clinical safety management, drug development, and precision medicine. However, managing ADRs remains a challenge due to the vast search space of drug combinations and the complexity of physiological responses. Current graph-based architectures often struggle to effectively integrate multi-scale biological information and frequently rely on fixed association matrices, which limits their ability to capture dynamic organ-level dependencies and generalize across diverse datasets. Here we propose CrossADR, a hierarchical framework for organ-level ADR prediction through cross-layer feature integration and cross-level associative learning. It incorporates a gated-residual-flow graph neural network to fuse multi-scale molecular features and utilizes a learnable ADR embedding space to dynamically capture latent biological correlations across 15 organ systems. Systematic evaluation on the newly constructed CrossADR-Dataset-covering 1,376 drugs and 946,000 unique combinations-demonstrates that CrossADR consistently achieves state-of-the-art performance across 80 distinct experimental scenarios and provides high-resolution insights into drug-related protein protein interactions and pathways. Overall, CrossADR represents a robust tool for cross-scale biomedical information integration, cross-layer feature integration as well as cross-level associative learning, and can be effectively utilized to prevent ADRs in clinical decision-making.
- Abstract(参考訳): 併用薬理療法は、相当な治療上の利点を提供するが、また、副作用薬反応(ADR)のかなりのリスクを生じさせる。
解釈可能な計算手法によるADRの正確な予測は、臨床安全管理、薬物開発、精密医療に不可欠である。
しかし、薬物の組み合わせの膨大な検索スペースと生理的反応の複雑さのため、ADRの管理は依然として課題である。
現在のグラフベースのアーキテクチャは、しばしばマルチスケールの生物学的情報を効果的に統合するのに苦労し、しばしば固定された関連行列に依存する。
ここでは,クロス層機能統合とクロスレベル連想学習による臓器レベルのADR予測のための階層的フレームワークであるCrossADRを提案する。
ゲート-残留フローグラフニューラルネットワークを組み込んで、マルチスケールの分子的特徴を融合させ、学習可能なADR埋め込み空間を利用して、15の臓器系にわたる潜伏生物学的相関を動的に捉える。
新たに構築されたCrossADR-Dataset-covering 1,376の薬物と946,000のユニークな組み合わせに関する体系的な評価では、CrossADRは80の異なる実験シナリオで一貫して最先端のパフォーマンスを達成し、薬物関連タンパク質の相互作用と経路に関する高精細な洞察を提供する。
全体として、CrossADRは、クロススケールなバイオメディカル情報統合、クロスレイヤー機能統合、およびクロスレベルな連想学習のための堅牢なツールであり、臨床意思決定におけるADRの予防に有効に活用することができる。
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