論文の概要: Segmentation-before-Staining Improves Structural Fidelity in Virtual IHC-to-Multiplex IF Translation
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2603.16160v1
- Date: Tue, 17 Mar 2026 06:25:50 GMT
- ステータス: 翻訳完了
- システム内更新日: 2026-03-18 17:42:07.129758
- Title: Segmentation-before-Staining Improves Structural Fidelity in Virtual IHC-to-Multiplex IF Translation
- Title(参考訳): セグメンテーション-before-Stainingは仮想IHC-Multiplex IF翻訳における構造忠実性を改善する
- Authors: Junhyeok Lee, Han Jang, Heeseong Eum, Joon Jang, Kyu Sung Choi,
- Abstract要約: 多発性免疫蛍光(mIF)は、無傷組織構造内の複数のバイオマーカーの同時定量を可能にする。
仮想染色は、広く利用可能な光電化学(IHC)からmIFチャネルを合成することができるが、現在のトランスレータは、核形態を明示的に制限することなくピクセルレベルの忠実度を最適化する。
この研究は、事前訓練された核分割基礎モデルから連続セル確率マップを注入する、監督不要でアーキテクチャに依存しない条件付け戦略を導入する。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 1.8848440735415501
- License: http://arxiv.org/licenses/nonexclusive-distrib/1.0/
- Abstract: Multiplex immunofluorescence (mIF) enables simultaneous single-cell quantification of multiple biomarkers within intact tissue architecture, yet its high reagent cost, multi-round staining protocols, and need for specialized imaging platforms limit routine clinical adoption. Virtual staining can synthesize mIF channels from widely available brightfield immunohistochemistry (IHC), but current translators optimize pixel-level fidelity without explicitly constraining nuclear morphology. In pathology, this gap is clinically consequential: subtle distortions in nuclei count, shape, or spatial arrangement propagate directly to quantification endpoints such as the Ki67 proliferation index, where errors of a few percent can shift treatment-relevant risk categories. This work introduces a supervision-free, architecture-agnostic conditioning strategy that injects a continuous cell probability map from a pretrained nuclei segmentation foundation model as an explicit input prior, together with a variance-preserving regularization term that matches local intensity statistics to maintain cell-level heterogeneity in synthesized fluorescence channels. The soft prior retains gradient-level boundary information lost by binary thresholding, providing a richer conditioning signal without task-specific tuning. Controlled experiments across Pix2Pix with U-Net and ResNet generators, deterministic regression U-Net, and conditional diffusion on two independent datasets demonstrate consistent improvements in nuclei count fidelity and perceptual quality, as the sole modifications. Code will be made publicly available upon acceptance.
- Abstract(参考訳): マルチプレックス免疫蛍光 (MIF) は、無傷組織構造内の複数のバイオマーカーの同時定量を可能にするが、その高い試薬コスト、多周染色プロトコル、特殊なイメージングプラットフォームの必要性は、定期的な臨床応用を制限している。
仮想染色は、広く利用可能な明るい電界免疫組織化学(IHC)からmIFチャネルを合成することができるが、現在のトランスレータは核形態を明示的に拘束することなくピクセルレベルの忠実度を最適化する。
核数、形状、空間配置の微妙な歪みは、Ki67増殖指数のような量子化エンドポイントに直接伝播し、数パーセントの誤差は治療関連リスクカテゴリをシフトさせる。
本研究は, 局所強度統計量と一致し, 合成蛍光チャネルにおけるセルレベル不均一性を維持する分散保存正規化項とともに, 予め訓練した核分割基礎モデルから連続セル確率マップを明示的な入力として注入する, 教師なしアーキテクチャに依存しない条件付け戦略を導入する。
ソフトプリエントは、二分しきい値によって失われる勾配レベルの境界情報を保持し、タスク固有のチューニングなしでよりリッチな条件付け信号を提供する。
Pix2PixとU-NetおよびResNetジェネレータ、決定論的回帰U-Net、および2つの独立データセット上の条件拡散による制御実験は、唯一の修正として、核数忠実度と知覚品質が一貫した改善を示す。
コードは受理時に公開される。
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