論文の概要: BVSIMC: Bayesian Variable Selection-Guided Inductive Matrix Completion for Improved and Interpretable Drug Discovery
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2603.18957v1
- Date: Thu, 19 Mar 2026 14:25:10 GMT
- ステータス: 翻訳完了
- システム内更新日: 2026-03-20 17:19:06.197324
- Title: BVSIMC: Bayesian Variable Selection-Guided Inductive Matrix Completion for Improved and Interpretable Drug Discovery
- Title(参考訳): BVSIMC : 改良・解釈可能な薬物発見のためのベイズ可変選択誘導誘導マトリックスコンプリート
- Authors: Sijian Fan, Liyan Xiong, Dayuan Wang, Guoshuai Cai, Ray Bai,
- Abstract要約: 薬物発見における側面特徴の変動選択を可能にする新しいベイズモデルを提案する。
少ない潜伏埋め込みを学習することにより、BVSIMCは予測精度と解釈可能性の両方を改善する。
本手法をシミュレーション研究および2つの薬物発見応用を通じて検証する。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 2.544539499281093
- License: http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/
- Abstract: Recent advances in drug discovery have demonstrated that incorporating side information (e.g., chemical properties about drugs and genomic information about diseases) often greatly improves prediction performance. However, these side features can vary widely in relevance and are often noisy and high-dimensional. We propose Bayesian Variable Selection-Guided Inductive Matrix Completion (BVSIMC), a new Bayesian model that enables variable selection from side features in drug discovery. By learning sparse latent embeddings, BVSIMC improves both predictive accuracy and interpretability. We validate our method through simulation studies and two drug discovery applications: 1) prediction of drug resistance in Mycobacterium tuberculosis, and 2) prediction of new drug-disease associations in computational drug repositioning. On both synthetic and real data, BVSIMC outperforms several other state-of-the-art methods in terms of prediction. In our two real examples, BVSIMC further reveals the most clinically meaningful side features.
- Abstract(参考訳): 薬物発見の最近の進歩は、副作用(例えば、薬物に関する化学的性質、疾患に関するゲノム情報)を組み込むことで、予測性能が大幅に向上することを示した。
しかし、これらの側面の特徴は関連性が大きく、しばしばうるさくて高次元である。
薬物発見における副次的特徴からの可変選択を可能にする新しいベイズモデルであるベイズ可変選択誘導誘導行列補完(BVSIMC)を提案する。
少ない潜伏埋め込みを学習することにより、BVSIMCは予測精度と解釈可能性の両方を改善する。
シミュレーションによる方法の検証と薬物発見の2つの応用について述べる。
1) Mycobacterium tuberculosis における薬剤耐性の予測
2【計算薬物再配置における新薬効関連性の予測】
合成データと実データの両方において、BVSIMCは予測の観点から他の最先端の手法よりも優れている。
私たちの2つの実例では、BVSIMCはより臨床的に有意義な側面の特徴を明らかにします。
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