論文の概要: DMMRL: Disentangled Multi-Modal Representation Learning via Variational Autoencoders for Molecular Property Prediction
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2603.21108v1
- Date: Sun, 22 Mar 2026 07:53:08 GMT
- ステータス: 翻訳完了
- システム内更新日: 2026-03-24 19:11:39.242929
- Title: DMMRL: Disentangled Multi-Modal Representation Learning via Variational Autoencoders for Molecular Property Prediction
- Title(参考訳): DMMRL:分子特性予測のための変分オートエンコーダによるマルチモーダル表現学習
- Authors: Long Xu, Junping Guo, Jianbo Zhao, Jianbo Lu, Yuzhong Peng,
- Abstract要約: 分子表現を共有(構造関連)およびプライベート(モダリティ特化)潜在空間に分散させる変分オートエンコーダを提案する。
提案手法は, 特性予測に最も有用な特徴を効果的に分離するものである。
7つのベンチマークデータセットの実験的検証は、最先端のアプローチと比較してDMMRLの優れたパフォーマンスを示している。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 7.709891405320469
- License: http://arxiv.org/licenses/nonexclusive-distrib/1.0/
- Abstract: Molecular property prediction constitutes a cornerstone of drug discovery and materials science, necessitating models capable of disentangling complex structure-property relationships across diverse molecular modalities. Existing approaches frequently exhibit entangled representations--conflating structural, chemical, and functional factors--thereby limiting interpretability and transferability. Furthermore, conventional methods inadequately exploit complementary information from graphs, sequences, and geometries, often relying on naive concatenation that neglects inter-modal dependencies. In this work, we propose DMMRL, which employs variational autoencoders to disentangle molecular representations into shared (structure-relevant) and private (modality-specific) latent spaces, enhancing both interpretability and predictive performance. The proposed variational disentanglement mechanism effectively isolates the most informative features for property prediction, while orthogonality and alignment regularizations promote statistical independence and cross-modal consistency. Additionally, a gated attention fusion module adaptively integrates shared representations, capturing complex inter-modal relationships. Experimental validation across seven benchmark datasets demonstrates DMMRL's superior performance relative to state-of-the-art approaches. The code and data underlying this article are freely available at https://github.com/xulong0826/DMMRL.
- Abstract(参考訳): 分子特性予測は、薬物発見と物質科学の基盤となり、様々な分子の様相をまたがる複雑な構造と不適切な関係を解消するために必要なモデルを必要とする。
既存のアプローチでは、しばしば絡み合った表現、つまり、構造的、化学的、機能的要素を融合させ、解釈可能性と伝達可能性を制限する。
さらに、従来の手法ではグラフ、シーケンス、ジオメトリからの補完的な情報を不適切に利用し、しばしばモーダル間の依存関係を無視する単純な結合に依存している。
本研究では,分子表現を共有(構造関連)およびプライベート(モダリティ特化)の潜在空間に分解するために,変分オートエンコーダを用いたDMMRLを提案する。
提案手法は特性予測において最も有用な特徴を効果的に分離するが,直交性やアライメントの正則化は統計的独立性やクロスモーダル整合性を促進する。
さらに、ゲートアテンション融合モジュールは、共有表現を適応的に統合し、複雑なモーダル間関係をキャプチャする。
7つのベンチマークデータセットの実験的検証は、最先端のアプローチと比較してDMMRLの優れたパフォーマンスを示している。
この記事の基盤となるコードとデータは、https://github.com/xulong0826/DMMRLで無償公開されている。
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