論文の概要: MolEvolve: LLM-Guided Evolutionary Search for Interpretable Molecular Optimization
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2603.24382v1
- Date: Wed, 25 Mar 2026 15:01:03 GMT
- ステータス: 翻訳完了
- システム内更新日: 2026-03-26 21:06:11.346767
- Title: MolEvolve: LLM-Guided Evolutionary Search for Interpretable Molecular Optimization
- Title(参考訳): MolEvolve: 解釈可能な分子最適化のためのLLM誘導進化探索
- Authors: Xiangsen Chen, Ruilong Wu, Yanyan Lan, Ting Ma, Yang Liu,
- Abstract要約: MolEvolveは、分子発見を自律的で先進的な計画問題として再構築する進化的フレームワークである。
我々は,Morevolveの自律探索が透明で可読な化学的洞察を進化させるだけでなく,特性予測と分子最適化の両タスクにおいて,ベースラインよりも優れていることを示す。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 16.187064406506977
- License: http://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
- Abstract: Despite deep learning's success in chemistry, its impact is hindered by a lack of interpretability and an inability to resolve activity cliffs, where minor structural nuances trigger drastic property shifts. Current representation learning, bound by the similarity principle, often fails to capture these structural-activity discontinuities. To address this, we introduce MolEvolve, an evolutionary framework that reformulates molecular discovery as an autonomous, look-ahead planning problem. Unlike traditional methods that depend on human-engineered features or rigid prior knowledge, MolEvolve leverages a Large Language Model (LLM) to actively explore and evolve a library of executable chemical symbolic operations. By utilizing the LLM to cold start and an Monte Carlo Tree Search (MCTS) engine for test-time planning with external tools (e.g. RDKit), the system self-discovers optimal trajectories autonomously. This process evolves transparent reasoning chains that translate complex structural transformations into actionable, human-readable chemical insights. Experimental results demonstrate that MolEvolve's autonomous search not only evolves transparent, human-readable chemical insights, but also outperforms baselines in both property prediction and molecule optimization tasks.
- Abstract(参考訳): 化学における深層学習の成功にもかかわらず、その影響は解釈可能性の欠如と、小さな構造的なニュアンスが急激な性質の変化を引き起こす活動の崖を解決できないことによって妨げられている。
現在の表現学習は、類似性の原理に縛られ、しばしばこれらの構造的活動的不連続性を捉えることに失敗する。
この問題を解決するために、分子発見を自律的で見事な計画問題として再構築する進化的枠組みであるMoleEvolveを紹介します。
人間工学的な特徴や厳格な事前知識に依存する従来の手法とは異なり、MorevolveはLLM(Large Language Model)を活用して、実行可能な化学記号操作のライブラリを積極的に探索し進化させる。
LLMをコールドスタートに利用し、外部ツール(RDKitなど)によるテストタイムプランニングにMCTS(Monte Carlo Tree Search)エンジンを使用することで、システムは最適な軌道を自律的に発見する。
このプロセスは透明な推論連鎖を進化させ、複雑な構造変換を実行可能な、人間可読な化学的洞察に翻訳する。
実験の結果、Morevolveの自律探索は透明で可読な化学的洞察を進化させるだけでなく、特性予測と分子最適化の両タスクにおいてベースラインを上回ります。
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