論文の概要: Validated Synthetic Patient Generation for Small Longitudinal Cohorts: Coagulation Dynamics Across Pregnancy
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2604.07557v1
- Date: Wed, 08 Apr 2026 19:56:24 GMT
- ステータス: 翻訳完了
- システム内更新日: 2026-04-10 18:34:05.535484
- Title: Validated Synthetic Patient Generation for Small Longitudinal Cohorts: Coagulation Dynamics Across Pregnancy
- Title(参考訳): 妊娠中における小縦長コホート用人工患者生成 : 凝固動態
- Authors: Jeffrey D. Varner, Maria Cristina Bravo, Carole McBride, Thomas Orfeo, Ira Bernstein,
- Abstract要約: 本稿では,現代のホップフィールドネットワーク理論に基づく生成フレームワークである多重度重み付き注意(SA)を提案する。
SAは、実際の患者プロファイルを連続したエネルギー環境に記憶パターンとして組み込み、ランゲヴィンダイナミクスを介して新規な合成患者を生成する。
パターンごとの多重度重みは、再訓練せずに推論時に稀な臨床サブグループの標的増幅を可能にする。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 0.0
- License: http://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
- Abstract: Small longitudinal clinical cohorts, common in maternal health, rare diseases, and early-phase trials, limit computational modeling: too few patients to train reliable models, yet too costly and slow to expand through additional enrollment. We present multiplicity-weighted Stochastic Attention (SA), a generative framework based on modern Hopfield network theory that addresses this gap. SA embeds real patient profiles as memory patterns in a continuous energy landscape and generates novel synthetic patients via Langevin dynamics that interpolate between stored patterns while preserving the geometry of the original cohort. Per-pattern multiplicity weights enable targeted amplification of rare clinical subgroups at inference time without retraining. We applied SA to a longitudinal coagulation dataset from 23 pregnant patients spanning 72 biochemical features across 3 visits (pre-pregnancy baseline, first trimester, and third trimester), including rare subgroups such as polycystic ovary syndrome and preeclampsia. Synthetic patients generated by SA were statistically, structurally, and mechanistically indistinguishable from their real counterparts across multiple independent validation tests, including an ordinary differential equation model of the coagulation cascade. A downstream utility test further showed that a mechanistic model calibrated entirely on synthetic patients predicted held-out real patient outcomes as well as one calibrated on real data. These results demonstrate that SA can produce clinically useful synthetic cohorts from very small longitudinal datasets, enabling data-augmented modeling in small-cohort settings.
- Abstract(参考訳): 母親の健康、まれな疾患、早期の臨床試験に共通する小さな経時的臨床コホートは、信頼性のあるモデルを訓練するには患者が少ないが、追加の入学を通じて拡張するには費用がかかり、時間がかかりすぎる。
本稿では、このギャップに対処する現代のホップフィールドネットワーク理論に基づく生成フレームワークである、多重度重み付き確率的注意(SA)を提案する。
SAは、実際の患者プロファイルを連続したエネルギー環境に記憶パターンとして埋め込んで、元のコホートの幾何学を保ちながら保存されたパターンの間を補間するランゲヴィンダイナミクスを介して、新しい合成患者を生成する。
パターンごとの多重度重みは、再訓練せずに推論時に稀な臨床サブグループの標的増幅を可能にする。
妊婦23名を対象に, 妊娠前ベースライン, 第1トリメスター, 第3トリメスター(妊娠前ベースライン, 妊娠前トリメスター, 妊娠前トリメスター)を対象とし, 多嚢胞性卵巣症候群や前立腺症などの稀なサブグループを含む, 72種類の生化学的特徴を有する縦断凝固データセットを作成した。
SAにより生成された合成患者は, 凝固カスケードの常微分方程式モデルを含む複数の独立性検証試験において, 統計的, 構造的, 機械的に実際の患者と区別不能であった。
さらに下流のユーティリティテストでは、人工患者で完全に校正されたメカニスティックモデルにより、実際の患者結果と実際のデータで校正された1つの結果が予測された。
これらの結果から,SAは極めて小さなデータセットから臨床的に有用な合成コホートを生成できることが示唆された。
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