論文の概要: MolCryst-MLIPs: A Machine-Learned Interatomic Potentials Database for Molecular Crystals
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2604.13897v1
- Date: Wed, 15 Apr 2026 14:08:53 GMT
- ステータス: 翻訳完了
- システム内更新日: 2026-04-16 20:38:32.571558
- Title: MolCryst-MLIPs: A Machine-Learned Interatomic Potentials Database for Molecular Crystals
- Title(参考訳): MolCryst-MLIPs:分子結晶のための機械学習型原子間ポテンシャルデータベース
- Authors: Adam Lahouari, Shen Ai, Jihye Han, Jillian Hoffstadt, Philipp Hoellmer, Charlotte Infante, Pulkita Jain, Sangram Kadam, Maya M. Martirossyan, Amara McCune, Hypatia Newton, Shlok J. Paul, Willmor Pena, Jonathan Raghoonanan, Sumon Sahu, Oliver Tan, Andrea Vergara, Jutta Rogal, Mark E. Tuckerman,
- Abstract要約: 機械学習型原子間ポテンシャル(MLIP)の分子結晶データベースMolCryst-MLIPについて述べる。
最初のリリースは、ベンザミド、ベンゾ酸、クマリン、デュレン、イソニコチナミド、ニアシナミド、ニコチナミド、ピラジナミド、レゾルシノールの9つの分子結晶系のための微調整MACEモデルを含む。
リリースされたモデルとデータセットは、検証されたMLIPのオープンデータベースとして成長し、異なる熱力学条件下で分子結晶多型をMDシミュレーションする準備が整った。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 0.059975999069143145
- License: http://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
- Abstract: We present an open Molecular Crystal (MC) database of Machine-Learned Interatomic Potentials (MLIP) called MolCryst-MLIPs. The first release comprises fine-tuned MACE models for nine molecular crystal systems -- Benzamide, Benzoic acid, Coumarin, Durene, Isonicotinamide, Niacinamide, Nicotinamide, Pyrazinamide, and Resorcinol -- developed using the Automated Machine Learning Pipeline (AMLP), which streamlines the entire MLIP development workflow, from reference data generation to model training and validation, into a reproducible and user-friendly pipeline. Models are fine-tuned from the MACE-MH-1 foundation model (omol head), yielding a mean energy MAE of 0.141 kJ/mol/atom and a mean force MAE of 0.648 kJ/mol/Angstrom across all systems. Dynamical stability and structural integrity, as assessed through energy conservation, P2 orientational order parameters, and radial distribution functions, are evaluated using molecular dynamics simulations. The released models and datasets constitute a growing open database of validated MLIPs, ready for production MD simulations of molecular crystal polymorphism under different thermodynamic conditions.
- Abstract(参考訳): 機械学習型原子間ポテンシャル(MLIP)のオープン分子結晶(MC)データベースMolCryst-MLIPを提案する。
最初のリリースでは、ベンザミド、ベンゾ酸、クマリン、デュレン、イソニコチナミド、ナイアシナミド、ニコチナミド、ピラジナミド、レゾルシノールの9つの分子結晶系のための微調整のMACEモデルが含まれており、MLIP開発ワークフロー全体を、参照データ生成からモデルトレーニング、バリデーションに至るまで、再現性とユーザフレンドリーなパイプラインに効率化する。
モデルは、MACE-MH-1基礎モデル(オールヘッド)から微調整され、平均エネルギーMAEは0.141 kJ/mol/atom、平均力MAEは0.648 kJ/mol/Angstromとなる。
分子動力学シミュレーションを用いて, エネルギー保存, P2配向秩序パラメータ, 放射分布関数の動的安定性と構造的整合性を評価する。
リリースされたモデルとデータセットは、検証されたMLIPのオープンデータベースとして成長し、異なる熱力学条件下で分子結晶多型をMDシミュレーションする準備が整った。
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