論文の概要: Mol-Debate: Multi-Agent Debate Improves Structural Reasoning in Molecular Design
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2604.20254v1
- Date: Wed, 22 Apr 2026 07:03:25 GMT
- ステータス: 翻訳完了
- システム内更新日: 2026-04-23 15:36:11.000015
- Title: Mol-Debate: Multi-Agent Debate Improves Structural Reasoning in Molecular Design
- Title(参考訳): Mol-Debate: 分子設計における構造推論の改善
- Authors: Wengyu Zhang, Xiao-Yong Wei, Qing Li,
- Abstract要約: Mol-Debateは、反復的な生成-決定-再定義ループによる動的推論を可能にする生成パラダイムである。
モル-ディベートは、強い一般および化学的基線に対して最先端の性能を発揮することを示す実験である。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 13.985773177895476
- License: http://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
- Abstract: Text-guided molecular design is a key capability for AI-driven drug discovery, yet it remains challenging to map sequential natural-language instructions with non-linear molecular structures under strict chemical constraints. Most existing approaches, including RAG, CoT prompting, and fine-tuning or RL, emphasize a small set of ad-hoc reasoning perspectives implemented in a largely one-shot generation pipeline. In contrast, real-world drug discovery relies on dynamic, multi-perspective critique and iterative refinement to reconcile semantic intent with structural feasibility. Motivated by this, we propose Mol-Debate, a generation paradigm that enables such dynamic reasoning through an iterative generate-debate-refine loop. We further characterize key challenges in this paradigm and address them through perspective-oriented orchestration, including developer-debater conflict, global-local structural reasoning, and static-dynamic integration. Experiments demonstrate that Mol-Debate achieves state-of-the-art performance against strong general and chemical baselines, reaching 59.82% exact match on ChEBI-20 and 50.52% weighted success rate on S$^2$-Bench. Our code is available at https://github.com/wyuzh/Mol-Debate.
- Abstract(参考訳): テキスト誘導分子設計は、AIによって駆動される薬物発見の鍵となる能力であるが、厳密な化学制約の下で、非線形分子構造を持つ逐次自然言語命令をマッピングすることは依然として困難である。
RAG、CoTプロンプト、ファインチューニング、あるいはRLなど、既存のアプローチのほとんどは、主にワンショット生成パイプラインで実装されたアドホックな推論の小さなセットを強調している。
対照的に、現実世界の薬物発見は、構造的実現可能性と意味的意図を一致させるために、動的で多面的な批判と反復的な改善に依存している。
そこで本研究では, 繰り返し生成・デベート・リファインループを通した動的推論が可能な生成パラダイム, Mol-Debateを提案する。
我々は、このパラダイムにおける重要な課題をさらに特徴付け、開発者とディベータの衝突、グローバルな局所構造推論、静的な統合など、視点指向のオーケストレーションを通じてそれらに対処する。
実験により、モル-ディベートは強い一般および化学的基線に対して最先端の性能を達成し、ChEBI-20では59.82%、S$^2$-Benchでは50.52%の精度で成功率を達成した。
私たちのコードはhttps://github.com/wyuzh/Mol-Debate.comから入手可能です。
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