論文の概要: Unified Multi-Foundation-Model Slide Representation for Pan-Cancer Recognition and Text-Guided Tumor Localization
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2604.22846v1
- Date: Tue, 21 Apr 2026 21:13:01 GMT
- ステータス: 翻訳完了
- システム内更新日: 2026-04-28 17:12:06.983464
- Title: Unified Multi-Foundation-Model Slide Representation for Pan-Cancer Recognition and Text-Guided Tumor Localization
- Title(参考訳): パンキャンセラ認識とテキストガイドによる腫瘍局所化のための統一マルチファウンデーションモデルスライド表現
- Authors: Tianyang Wang, Ziyu Su, Abdul Rehman Akbar, Usama Sajjad, Lina Gokhale, Charles Rabolli, Wei Chen, Anil Parwani, Muhammad Khalid Khan Niazi,
- Abstract要約: ASTRAは、異種基礎モデル表現を共有スライドレベル表現空間に統合するパンカンサーフレームワークである。
ASTRAは4カテゴリの分類、3クラスの固形腫瘍タイピング、16クラスのがんタイピング、およびピクセルレベルの監督なしにテキスト誘導された腫瘍の局在をサポートする。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 7.89192092196746
- License: http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/
- Abstract: The expanding ecosystem of pathology foundation models has produced powerful but fragmented tile-level representations, limiting their use in clinical tasks that require unified slide-level reasoning and interpretable linkage to clinically meaningful information. We present ASTRA, a pan-cancer framework that integrates heterogeneous foundation-model representations into a shared slide-level representation space and semantically grounds that space using structured pathology annotation fields, including classification category, cancer type, and anatomic site. ASTRA combines sparse mixture-of-experts contextualization, masked multi-model reconstruction, and contrastive alignment to structured pathology prompts to learn slide representations that support 4-category classification, 3-class solid tumor typing, 16-class cancer typing, and text-guided tumor localization without pixel-level supervision. Developed on a CHTN cohort of 10,359 whole-slide images (WSIs) spanning 16 tumor types, ASTRA consistently improves pan-cancer classification across four pathology foundation-model backbones, achieving up to 97.8% macro-AUC for 4-category classification, 99.7% for 3-class solid tumor typing, and 99.2% for 16-class cancer typing. For tumor localization, ASTRA achieves a mean Dice of 0.897 on an annotated in-domain CHTN subset (n = 380) spanning 16 cancer types and 0.738 on an external TCGA cohort (n = 1,686) spanning four cancer types. These results demonstrate that minimal structured pathology annotation fields derived from slide-level metadata can provide effective semantic supervision for unified slide representation learning, enabling both pan-cancer prediction and weakly supervised tumor localization within a single framework.
- Abstract(参考訳): 病理基盤モデルのエコシステムが拡大し、強力なタイルレベルの表現が生み出され、スライドレベルの推論と解釈可能なリンクを臨床的に意味のある情報に統一する必要のある臨床タスクでの使用が制限された。
異種基礎モデル表現を共有スライドレベル表現空間に統合し, 分類分類, 癌タイプ, 解剖学的部位を含む構造的病理アノテーションフィールドを用いてその空間を意味的にグラウンド化するパン・カンサー・フレームワークASTRAを提案する。
ASTRAは、スパースミックス・オブ・エキスパート・コンテクスト化、マスク付きマルチモデル再構成、構造化された病理へのコントラストアライメントを組み合わせることで、4カテゴリ分類、3クラスソリッドな腫瘍タイピング、16クラスのがんタイピング、ピクセルレベルの監督なしにテキスト誘導された腫瘍局所化をサポートするスライド表現の学習を促す。
腫瘍型16種類にまたがる10,359枚の全スライディング画像(WSI)からなるCHTNコホート上に開発されたASTRAは、4つの病理基盤モデルバックボーンのパン・カンサー分類を一貫して改善し、4つの分類で97.8%のマクロ・AUC、3つの分類で99.7%の固形腫瘍型付け、3クラスで99.2%のがん型付けを達成した。
腫瘍の局在について、ASTRAは16種類の癌にまたがる注釈付き内ドメインCHTNサブセット(n = 380)では0.897、外部のTCGAコホート(n = 1,686)では0.738である。
以上の結果から,スライドレベルのメタデータから導かれる最小構造的病理アノテーションフィールドは,単一フレームワーク内での汎癌予測と弱教師付き腫瘍局所化を両立させることにより,統合されたスライド表現学習に効果的な意味的管理を可能にすることが示唆された。
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