論文の概要: KAYRA: A Microservice Architecture for AI-Assisted Karyotyping with Cloud and On-Premise Deployment
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2604.26869v1
- Date: Wed, 29 Apr 2026 16:35:31 GMT
- ステータス: 翻訳完了
- システム内更新日: 2026-04-30 15:59:36.494998
- Title: KAYRA: A Microservice Architecture for AI-Assisted Karyotyping with Cloud and On-Premise Deployment
- Title(参考訳): KAYRA: クラウドとオンプレミスのデプロイによるAI支援のカリオタイピングのためのマイクロサービスアーキテクチャ
- Authors: Attila Pintér, Javier Rico, Attila Répai, Jalal Al-Afandi, Adrienn Éva Borsy, András Kozma, Hajnalka Andrikovics, György Cserey,
- Abstract要約: KAYRAは、臨床細胞遺伝学研究室の運用上の制約の中で機能するエンドツーエンドの核タイピングシステムである。
KAYRAはコンテナ化されたマイクロサービスパイプラインとして設計されており、MLスタックにはEfficientNet-B5 + U-Netセマンティックセグメント、Mask R-CNN(ResNet-50 + FPN)インスタンス、ResNet-18インスタンスが組み込まれている。
459染色体上の2つの商用基準核型分類システムに対する試験的臨床評価は、強い経験的性能を示す。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 0.0
- License: http://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
- Abstract: We present KAYRA, an end-to-end karyotyping system that operates inside the operational constraints of a clinical cytogenetic laboratory. KAYRA is architected as a containerized microservice pipeline whose ML stack combines an EfficientNet-B5 + U-Net semantic segmenter, a Mask R-CNN (ResNet-50 + FPN) instance detector, and a ResNet-18 classifier, orchestrated through a cascaded ROI-narrowing strategy that focuses each downstream model on the chromosome-bearing region. The same container images are deployed both as a cloud service and as an on-premise installation, supporting clinical environments where patient-data egress is not permitted as well as those where it is. A pilot clinical evaluation against two commercial reference karyotyping systems on 459 chromosomes from 10 metaphase spreads shows segmentation accuracy of 98.91 % (vs. 78.21 % / 40.52 %), classification accuracy of 89.1 % (vs. 86.9 % / 54.5 %), and rotation accuracy of 89.76 % (vs. 94.55 % / 78.43 %). KAYRA improves over the older density-thresholding reference on all three axes (p < 0.0001 for segmentation and classification by Fisher's exact test on chromosome-level counts), and on segmentation also against the modern AI- supported reference (p < 0.0001); on classification the difference vs. the modern AI reference is not statistically significant at the present test-set size (p = 0.34). The system reaches TRL 6 maturity and integrates the human-in-the-loop expert-review workflow that diagnostic cytogenetic practice requires. The thesis of this paper is that a multi-model cytogenetic AI service can be packaged as a microservice architecture supporting flexible deployment - cloud-hosted or on-premise - while delivering strong empirical performance on a pilot clinical evaluation.
- Abstract(参考訳): 臨床細胞遺伝学実験室の操作制約の中で機能するエンドツーエンドの核タイピングシステムであるKAYRAについて述べる。
KAYRAはコンテナ化されたマイクロサービスパイプラインとして設計されており、MLスタックにはEfficientNet-B5 + U-Netセマンティックセマンティクスセグメンタ、Mask R-CNN(ResNet-50 + FPN)インスタンス検出器、およびResNet-18分類器が組み込まれている。
同一のコンテナイメージは、クラウドサービスとオンプレミスのインストールの両方としてデプロイされる。
10変態から459染色体の2つの商業的基準核タイピングシステムに対する試験的な臨床評価では、セグメント化精度は98.91 % (vs. 78.21 % / 40.52 %)、分類精度は89.1 % (vs. 86.9 % / 54.5 %)、回転精度は89.76 % (vs. 94.55 % / 78.43 %)である。
KAYRAは、全ての3つの軸上の古い密度保持参照(P < 0.0001)を改良し(P < 0.0001 はフィッシャーの染色体レベル数に関する正確なテストによるセグメンテーションと分類)、また、現代のAIがサポートしている参照(p < 0.0001)に対するセグメンテーションでは、現在のテストセットサイズ(p = 0.34)において、現代のAI参照との差は統計的に有意ではない(p = 0.34)。
このシステムはTRL 6の成熟度に達し、細胞遺伝学的プラクティスを診断するヒューマン・イン・ザ・ループの専門家・レビューワークフローを統合する。
本稿では,マルチモデルサイトジェネティックAIサービスを,柔軟なデプロイメント – クラウドホスト,オンプレミス – をサポートするマイクロサービスアーキテクチャとしてパッケージ化して,試験的臨床評価において強力な経験的パフォーマンスを実現する,という論文を紹介する。
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