論文の概要: One Sequence to Segment Them All: Efficient Data Augmentation for CT and MRI Cross-Domain 3D Spine Segmentation
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2605.03098v1
- Date: Mon, 04 May 2026 19:26:29 GMT
- ステータス: 翻訳完了
- システム内更新日: 2026-05-06 19:35:43.621646
- Title: One Sequence to Segment Them All: Efficient Data Augmentation for CT and MRI Cross-Domain 3D Spine Segmentation
- Title(参考訳): CTとMRIのクロスドメイン3次元椎間板分割のための効率的なデータ拡張法
- Authors: Nathan Molinier, Hendrik Möller, Thomas Dagonneau, Anna Curto-Vilalta, Robert Graf, Matan Atad, Daniel Rueckert, Jan S. Kirschke, Julien Cohen-Adad,
- Abstract要約: 深層学習に基づく医療画像セグメンテーションは、臨床診断を支援し、新しい治療戦略を開発するためにますます利用されている。
しかし、高品質な注釈付きデータの不足や画像プロトコル間の一般化が不十分なため、モデル性能は依然として制限されている。
この制限はMRIやCTでは特に顕著であり、モデルは通常1回の取得シーケンスでトレーニングされる。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 14.430939194449229
- License: http://arxiv.org/licenses/nonexclusive-distrib/1.0/
- Abstract: Deep learning-based medical image segmentation is increasingly used to support clinical diagnosis and develop new treatment strategies. However, model performance remains limited by the scarcity of high-quality annotated data and insufficient generalization across imaging protocols. This limitation is particularly evident in MRI and CT, where models are typically trained on a single acquisition sequence and exhibit reduced robustness when applied to unseen sequences or contrasts. Although data augmentation is widely used to improve general robustness on medical images, its impact on cross-modality generalization has not been quantitatively explored. In this work, we study a targeted set of data augmentation techniques designed to improve cross-modality transfer. We train three spine segmentation models, each on a single-modality/sequence dataset, and evaluate them across seven out-of-distribution datasets (spanning CT and MRI), reflecting a realistic single-sequence training and multi-sequence/contrast/modality deployment scenario. Our results demonstrate substantial performance gains on unseen domains (average Dice gain of 155 %) while preserving in-domain accuracy (average Dice decrease of 0.008 %), including effective transfer between CT and MRI. To mitigate the computational cost typically associated with strong data augmentation, we implement GPU-optimized augmentations that maintain, and even improve, training efficiency by approximately 10 %. We release our approach as an open-source toolbox, enabling seamless integration into commonly used frameworks such as nnUNet and MONAI. These augmentations significantly enhance robustness to heterogeneous clinical imaging scenarios without compromising training speed.
- Abstract(参考訳): 深層学習に基づく医療画像セグメンテーションは、臨床診断を支援し、新しい治療戦略を開発するためにますます利用されている。
しかし、高品質な注釈付きデータの不足や画像プロトコル間の一般化が不十分なため、モデル性能は依然として制限されている。
この制限はMRIやCTでは特に顕著であり、モデルは通常、単一の取得シーケンスでトレーニングされ、目に見えないシーケンスやコントラストに適用した場合、ロバスト性が低下する。
データ拡張は医療画像の全般的堅牢性向上に広く利用されているが、その相互モダリティの一般化への影響は定量化されていない。
本研究では,モダリティ間移動を改善するために,対象とするデータ拡張手法について検討する。
3つのスピンセグメンテーションモデルを1つのモード/シーケンスデータセットでトレーニングし、7つのアウト・オブ・ディストリビューションデータセット(スパンニングCTとMRI)で評価し、現実的な単一シーケンストレーニングとマルチシーケンス/コントラスト/モダリティデプロイメントシナリオを反映する。
以上の結果より,CTとMRIを効果的に移行するなど,ドメイン内精度(平均Dice低下率0.008%)を保ちながら,未確認領域(平均Dice上昇率155%)に対して顕著なパフォーマンス向上を示した。
強いデータ拡張に関連する計算コストを軽減するため、GPU最適化拡張を実装し、トレーニング効率を約10%向上する。
当社のアプローチはオープンソースツールボックスとしてリリースされており、nnUNetやMONAIといった一般的なフレームワークへのシームレスな統合を可能にしています。
これらの拡張は、訓練速度を損なうことなく、不均一な臨床画像のシナリオに対する堅牢性を著しく向上させる。
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