論文の概要: MicroDiffuse3D: A Foundation Model for 3D Microscopy Imaging Restoration
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2605.08566v1
- Date: Fri, 08 May 2026 23:58:35 GMT
- ステータス: 翻訳完了
- システム内更新日: 2026-05-12 23:28:49.74419
- Title: MicroDiffuse3D: A Foundation Model for 3D Microscopy Imaging Restoration
- Title(参考訳): MicroDiffuse3D : 3次元顕微鏡画像再生の基礎モデル
- Authors: Yongkang Li, Brian Wong, King Wai Chiu, Hanwen Xu, Tangqi Fang, Erin Dunnington, Dan Fu, Sheng Wang,
- Abstract要約: ケミカルイメージングは、細胞、組織、生体システムのラベルのない可視化を可能にする。
その幅広い用途は、特に3次元イメージングにおいて、遅いデータ取得によって制限されている。
本稿では,3次元顕微鏡画像復元のための基礎モデルであるMicroDiffuse3Dを提案する。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 3.8803751453810165
- License: http://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
- Abstract: Chemical imaging enables label-free visualization of cells, tissues and living systems while providing direct biochemical information that is difficult to obtain with conventional fluorescence microscopy. Despite its promise in applications ranging from intraoperative diagnosis to drug-response analysis, its broader use remains limited by slow data acquisition, particularly for three-dimensional imaging. Here we present MicroDiffuse3D, a pretrained foundation model for 3D microscopy image restoration that recovers high-quality volumetric structure from degraded low-resolution measurements acquired at substantially higher throughput. We evaluated MicroDiffuse3D across three challenging restoration settings, including 3D super-resolution under 16-fold volumetric sparsity, joint degradation in resolution and noise, and 3D denoising in the low signal-to-noise ratio (SNR) regime, where the model delivered clear gains over strong baselines. Under the sparse 3D super-resolution setting, MicroDiffuse3D produced clearer continuity across depth with fewer artifacts and improved segmentation quality by 10.58% and line-profile concordance by 15.59%. Together, our results establish pretrained 3D restoration as a broadly applicable strategy for overcoming the throughput and SNR limitations in volumetric chemical imaging, enabling high-resolution analysis at scales and speeds that were previously difficult to achieve.
- Abstract(参考訳): ケミカルイメージングは、従来の蛍光顕微鏡では得られ難い直接の生化学的情報を提供しながら、細胞、組織、生体系のラベルのない可視化を可能にする。
術中診断から薬物応答解析まで幅広い応用が期待されているが、その用途は低速なデータ取得、特に3次元イメージングに限られている。
本稿では,3次元顕微鏡画像復元のための基礎モデルであるMicroDiffuse3Dについて述べる。
マイクロディフューズ3Dは16倍の体積空間での3次元超解像、分解能とノイズの結合劣化、低信号-雑音比 (SNR) の3次元ノイズ化を含む3つの難解な復元条件で評価した。
スパース3Dの超高解像度設定の下で、マイクロディフューズ3Dは、より少ないアーティファクトで、セグメンテーション品質を10.58%改善し、15.59%のラインアップコンコーディネートを実現した。
その結果, 従来達成が困難であったスケール, 速度での高分解能解析を可能にし, スループットとSNRの限界を克服するための広範に適用可能な戦略として, 事前訓練した3D復元が確立された。
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