論文の概要: Bayesian In Vivo Tracking of Synapses using Joint Poisson Deconvolution and Diffeomorphic Registration
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2605.13455v1
- Date: Wed, 13 May 2026 12:49:22 GMT
- ステータス: 翻訳完了
- システム内更新日: 2026-05-14 23:30:28.04797
- Title: Bayesian In Vivo Tracking of Synapses using Joint Poisson Deconvolution and Diffeomorphic Registration
- Title(参考訳): 結合型ポアソン脱畳と拡散型レジストレーションを用いたシナプスのベイズ的インビボ追跡
- Authors: Shashwat Kumar, Dominic M. Padova, Binish Narang, Gabrielle I. Coste, Austin R. Graves, Richard L. Huganir, Adam S. Charles, Michael I. Miller, Anuj Srivastava,
- Abstract要約: 非線形組織変形下で動く様々な輝度点源としてシナプスをモデル化するためのテンプレートベースの新しいフレームワークを提案する。
マウスで2週間にわたって観察された蛍光シナプスの2D+tシミュレーションデータセットと3D+t長手テクスチインバイオグラフィーデータセットについて,本フレームワークを実証した。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 9.20140185109962
- License: http://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
- Abstract: Synapses are densely packed submicron structures that dynamically reorganize during learning and memory formation. Longitudinal \textit{in vivo} imaging of fluorescently tagged synaptic receptors offers a promising opportunity to study large-scale synaptic dynamics and how these processes are disrupted in neurological disease. However, in vivo imaging with 2-photon microscopy uses low laser power and therefore suffers from low signal-to-noise ratio (SNR) and high shot noise, nonlinear tissue motion between days, nonstationary fluctuations in synaptic fluorescence, and significant blur induced by the microscope point spread function (PSF). Together, these factors make it challenging to detect and track synapses, especially in regions with high synaptic density. This paper presents a novel template-based framework for modeling synapses as varying luminance point sources that move under a nonlinear tissue deformation. Taking a unified Bayesian approach, we apply this model to microscopy data by deriving a posterior that incorporates a diffeomorphic mapping for domain warping, a Gaussian point spread function for the imaging process, and a Poisson observation model for raw photon counts. The Bayesian solution simultaneously: (1) Constructs a probabilistic template of synapse locations, (2) denoises and deconvolves the image data, (3) infers fluorescence intensities, (4) performs diffeomorphic image registration to correct for tissue motion, and (5) provides confidence regions for these parameter estimates. We demonstrate the framework on both a 2D+t simulated dataset and a 3D+t longitudinal \textit{in vivo} microscopy dataset of fluorescent synapses imaged in a mouse over two weeks.
- Abstract(参考訳): シナプスは高密度に充填されたサブミクロン構造であり、学習や記憶形成の過程で動的に再編成される。
蛍光タグ付けされたシナプス受容体の縦方向の‘textit{in vivo’イメージングは、大規模なシナプスのダイナミクスと、これらのプロセスが神経疾患でどのように破壊されるかを研究する上で有望な機会となる。
しかし, 2光子顕微鏡を用いた生体内イメージングでは, レーザーパワーが低く, 低信号対雑音比(SNR)と高ショットノイズ, 日中非線形組織運動, シナプス蛍光の非定常変動, 顕微鏡点拡散機能(PSF)によって誘発される顕著なぼかしが生じる。
これらの要因は、特にシナプス密度の高い領域においてシナプスの検出と追跡を困難にしている。
本稿では, 非線形組織変形の下で移動する様々な輝度点源として, シナプスをモデル化するためのテンプレートベースの新しいフレームワークを提案する。
統一されたベイズ的手法を用いて,ドメインワープの微分同相写像,画像処理のためのガウス点展開関数,および生光子数に対するポアソン観測モデルを用いて,このモデルを顕微鏡データに適用する。
ベイズ解は,(1)シナプス位置の確率的テンプレートを構築し,(2)画像データを分解・分解し,(3)蛍光強度を推定し,(4)組織運動の補正のために拡散像登録を行い,(5)これらのパラメータ推定のための信頼領域を提供する。
マウスで2週間にわたって観察された蛍光シナプスの2D+tシミュレーションデータセットと3D+t長手顕微鏡データセットの双方について,本フレームワークを実証した。
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