論文の概要: Fairness Definitions and Metrics in Deep Reinforcement Learning for Drug Discovery in Healthcare: A Rapid Evidence Review
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2606.02902v1
- Date: Mon, 01 Jun 2026 21:18:27 GMT
- ステータス: 翻訳完了
- システム内更新日: 2026-06-03 22:00:04.611739
- Title: Fairness Definitions and Metrics in Deep Reinforcement Learning for Drug Discovery in Healthcare: A Rapid Evidence Review
- Title(参考訳): 医療における薬物発見のための深層強化学習におけるフェアネス定義とメトリクス--迅速エビデンスレビュー
- Authors: Esmaeil Shakeri, Ronnie de Souza Santos, Behrouz Far,
- Abstract要約: DRLに基づく薬物発見において、公正性がどのように定義され、測定され、テストされるかの正確な合成は存在しない。
i)データセットの構成と戦略、特に足場とランダムの分割、評価と分配のシフト、(ii)報酬設計(QED、ドッキング、毒性、合成アクセシビリティ)が、がんターゲットに重点を置いたバイアスをいかに生み出すか、あるいは緩和するか、(iii)測定可能な指標がフェアネスを最もよく捉えているか、という3つの質問に焦点をあてる。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 2.198430261120653
- License: http://arxiv.org/licenses/nonexclusive-distrib/1.0/
- Abstract: Deep reinforcement learning (DRL) is increasingly applied to de novo molecular design, but choices in data, rewards, and evaluation can yield uneven performance across disease areas and chemotypes. Despite this, there is no concise synthesis of how fairness is defined, measured, and tested in DRL-based drug discovery. In this rapid evidence review, we synthesize fairness definitions and metrics for DRL-driven molecule generation in healthcare. We focus on three questions: (i) how dataset composition and split strategies, especially scaffold versus random splits, affect evaluation and distribution shift; (ii) how reward design (e.g., QED, docking, toxicity, synthetic accessibility) can create or mitigate bias, with emphasis on cancer targets; and (iii) which measurable metrics best capture fairness. This includes parity across cancer versus non-cancer indications and across cancer subtypes. It also includes distributional balance in key physicochemical descriptors, scaffold/chemotype diversity, groupwise validity, toxicity, and synthetic accessibility. From 2017 onward, we searched major biomedical, computer science, and engineering literature databases and used arXiv for horizon scanning. Records were screened using PRISMA-style procedures and analyzed via content coding to link reported parity outcomes to dataset and reward choices. Our review provides a concise set of fairness definitions and metrics for DRL molecule generation. It offers practical guidance for reporting distribution parity and outcome parity. It also summarizes how dataset and reward choices relate to observed parity effects and identifies open gaps relevant to trustworthy, cancer-relevant DRL generation.
- Abstract(参考訳): 深部強化学習(DRL)はデ・ノボ分子設計にますます応用されているが、データ、報酬、評価の選択は、疾患領域や化学タイプの不均一なパフォーマンスをもたらす可能性がある。
それにもかかわらず、DRLに基づく薬物発見において、公正性がどのように定義され、測定され、テストされるかの正確な合成は存在しない。
この素早いエビデンスレビューでは、医療におけるDRL駆動分子生成のためのフェアネス定義とメトリクスを合成する。
私たちは3つの質問に焦点をあてています。
一 データセットの構成及び分割戦略、特に足場とランダムの分割が評価及び分散シフトに与える影響
二 報酬設計(例えば、QED、ドッキング、毒性、合成アクセシビリティ)が、がん標的に重点を置いたバイアスを発生又は緩和する方法
三 測定可能な指標が公正を最もよく捉えているもの。
これには、がんと非がんの表示、およびがんのサブタイプ間のパリティが含まれる。
また、主要な物理化学的記述子、足場/化学タイプ多様性、集団的妥当性、毒性、合成アクセシビリティの分布バランスも含む。
2017年以降、我々はバイオメディカル、コンピュータサイエンス、工学文献データベースを検索し、地平線スキャンにarXivを使用した。
PRISMAスタイルのプロシージャを使用してレコードをスクリーニングし、コンテンツコーディングを通じて分析し、報告されたパリティ結果とデータセットと報酬の選択をリンクした。
本稿では,DRL分子生成のための簡潔なフェアネス定義と指標について述べる。
分布パリティと結果パリティを報告するための実践的なガイダンスを提供する。
また、データセットと報酬の選択が観察されたパリティ効果とどのように関連しているかを要約し、信頼に値する癌関連DRL生成に関連するオープンギャップを特定する。
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