論文の概要: Unsupervised Pattern Analysis in Japanese Veterinary Toxicology: A Regulatory-Compliant Framework for Cross-Species Risk Assessment
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2606.06207v1
- Date: Thu, 04 Jun 2026 14:14:16 GMT
- ステータス: 翻訳完了
- システム内更新日: 2026-06-05 22:39:44.850237
- Title: Unsupervised Pattern Analysis in Japanese Veterinary Toxicology: A Regulatory-Compliant Framework for Cross-Species Risk Assessment
- Title(参考訳): 日本獣医学における教師なしパターン分析--異種間リスクアセスメントのための規則適合型フレームワーク
- Authors: Yukiko Kawakami, Mohammad Shirazi, Ryo Shimizuwa, Saito Shinoda, Alireza Mortazavi, Matsumoto Kawahara,
- Abstract要約: 本研究では,NVAL(National Veterinary Assay Laboratory, NVAL)データベースを用いた, パターン発見のための規制統合型教師なしフレームワークを提案する。
類似性に基づくクラスタリングと次元減少を応用して潜在毒性構造を同定する。
4,120人の高信頼ADEレポートの分析により、3つの重要な種群が同定された。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 0.0
- License: http://creativecommons.org/publicdomain/zero/1.0/
- Abstract: Veterinary pharmacovigilance systems are essential for monitoring adverse drug events (ADEs), yet existing approaches often fail to capture region-specific toxicity patterns shaped by local biological and regulatory contexts. In Japan, these challenges are amplified by species-specific metabolic differences and reporting practices defined by the Ministry of Agriculture, Forestry, and Fisheries (MAFF). Most prior work relies on prediction-oriented models, limiting mechanistic interpretability. This study proposes a regulatory-integrated unsupervised framework for pattern discovery using the National Veterinary Assay Laboratory (NVAL) database. ADEs are encoded into organ system-aligned representations and adjusted for species-specific reporting biases, enabling cross-species comparison. Similarity-based clustering and dimensionality reduction are applied to identify latent toxicity structures. Analysis of 4,120 high-confidence ADE reports (9,080 drug-ADE combinations) identified three significant species clusters (p < 0.01), including hepatic-dominant patterns in companion animals (0.42 $\pm$ 0.06), renal toxicity in ruminants (0.39 $\pm$ 0.07), and dermatological sensitivity in sheep (0.35 $\pm$ 0.07). Drug-level clustering achieved 83% alignment with pharmacological classes, while cosine similarity outperformed alternative metrics (silhouette score: 0.48; cluster precision: 87%). Regulatory validation showed strong agreement with established classifications. These findings demonstrate that regulation-aligned unsupervised analysis can uncover biologically meaningful, region-specific toxicity patterns, providing an interpretable and scalable framework for veterinary drug safety assessment.
- Abstract(参考訳): 獣医の薬物移動システムは、有害薬物イベント(ADE)のモニタリングに不可欠であるが、既存のアプローチでは、局所的な生物学的および規制的な文脈によって形成された地域固有の毒性パターンを捉えることができないことが多い。
日本では,これらの課題は,農林水産省(MAFF)が定義する種別代謝差や報告の実践によって増幅されている。
これまでの作業のほとんどは予測指向モデルに依存しており、機械的解釈可能性を制限する。
本研究では,NVAL(National Veterinary Assay Laboratory, NVAL)データベースを用いた, パターン発見のための規制統合型教師なしフレームワークを提案する。
ADEは臓器系に整列した表現にコード化され、種特異的な報告バイアスに調整され、種間比較が可能である。
類似性に基づくクラスタリングと次元減少を応用して潜在毒性構造を同定する。
4,120件の高信頼ADEレポート (9,080の薬物とADEの組み合わせ) の分析では、3つの重要な種群 (p < 0.01) が同定され、これには、共生動物の肝優占パターン (0.42$\pm$ 0.06) 、反抗動物の腎毒性 (0.39$\pm$ 0.07) 、羊の皮膚学感受性 (0.35$\pm$ 0.07) が含まれる。
薬物レベルのクラスタリングは薬理学のクラスと83%のアライメントを達成し、コサインの類似性は代替指標(シルエットスコア:0.48、クラスタ精度:87%)を上回った。
規制の検証は、確立された分類と強く一致した。
これらの結果から, 規制に整合した無監督分析は, 生物学的に有意な, 地域特異的な毒性パターンを解明し, 獣医学的医薬品安全性評価のための解釈可能な, スケーラブルな枠組みを提供する可能性が示唆された。
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