論文の概要: Automatic Extraction of Structured Information from Brain MRI Reports Using an Open-Weight Large Language Model
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2606.07721v1
- Date: Fri, 05 Jun 2026 15:57:35 GMT
- ステータス: 翻訳完了
- システム内更新日: 2026-06-09 14:42:05.364774
- Title: Automatic Extraction of Structured Information from Brain MRI Reports Using an Open-Weight Large Language Model
- Title(参考訳): オープンウェイト大言語モデルを用いた脳MRI画像からの構造化情報の自動抽出
- Authors: Kaouther Mouheb, Amos Pomp, Antoine Manenti, Romy de Haan, Farog Faghir, Joy Martens, Harro Seelaar, Francesco Mattace-Raso, Meike W. Vernooij, Frank J. Wolters, Stefan Klein, Esther E. Bron,
- Abstract要約: 神経放射線科医が著述した第3次記憶クリニックの脳MRI947例について検討した。
オープンウェイトLLM LLaMA 3.1の性能を,異なる言語(オランダ語対英訳)と数発のプロンプトを用いて評価した。
少ないショットプロンプトは数値変数のパフォーマンスを向上させるが、位置固有の変数には課題が残る。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 0.2974983678844722
- License: http://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
- Abstract: Objectives: Automatic data extraction from free-text radiology reports enables large-scale research, but few studies assessed the performance of large language models (LLMs) on Dutch neuroradiology reports. Methods: We analyzed 947 brain MRI reports from a tertiary memory clinic (2016-2021), authored by consultant neuroradiologists. Trained medical students annotated thirty variables; 100 reports were double-annotated to assess inter-rater reliability. We evaluated the performance of the open-weight LLM LLaMA 3.1 using different languages (Dutch vs. English translation) and few-shot prompting with different example selection strategies. Performance was evaluated using balanced accuracy for categorical variables, accuracy and mean absolute error for counts, and text similarity for free-text. Metrics were computed across 10 random splits of the 947 reports. Results: LLaMA 3.1 demonstrated high zero-shot performance for visual rating scores (mean [95%-CI]): Medial Temporal Atrophy: 90% [77-100%] on the left and 96% [94-99%] on the right, Global Cortical Atrophy: 87% [83-91%], and Fazekas: 94% [93-96%]. Microbleed mentions were detected with 93% accuracy [92-95%] and infarct mentions with 82% [80-84%]. Text similarity for lesion location reached 0.95 [0.95-0.96]. Performance was lower for numerical variables: 80% [78-82%] for the number of microbleeds and 66% [63-68%] for infarcts. English translation yielded comparable results. Few-shot prompting improved performance for numerical variables, achieving 92% [90-93%] for microbleeds and 81% [77-85%] for infarcts using structural similarity-based selection. Conclusion: LLaMA 3.1 shows strong potential for extracting data from Dutch neuroradiology reports. Few-shot prompting enhances performance for numerical variables, whereas challenges remain for location-specific variables.
- Abstract(参考訳): 目的: 自由テキストラジオロジーレポートからの自動データ抽出は大規模な研究を可能にするが, オランダの神経放射線学レポートにおいて大規模言語モデル(LLM)の性能を評価する研究はほとんどない。
方法: 神経放射線技師による第3次記憶クリニック(2016-2021)の脳MRI947例について検討した。
研修医は30変数をアノテートし、100のレポートはラター間の信頼性を評価するために二重アノテートされた。
異なる言語(オランダ語と英語の翻訳)と、異なるサンプル選択戦略による少数ショットプロンプトによるオープンウェイトLLM LLaMA 3.1の性能評価を行った。
評価は,分類変数の平衡精度,数値の平均絶対誤差,自由テキストのテキスト類似度を用いて行った。
メトリクスは、947のレポートの10のランダムな分割で計算された。
結果: LLaMA 3.1 は視力評価スコア (平均 [95%-CI]) に対して高いゼロショット性能を示した。中等度萎縮:90% [77-100%) 右96% [94-99%) 、大脳皮質萎縮:87% [83-91%) 、ファゼカス94% [93-96%) であった。
93%(92-95%)の精度で微血的言及が検出され、82%(80-84%)の梗塞性言及が検出された。
病変位置のテキスト類似性は 0.95 [0.95-0.96] に達した。
数値変数では80%[78-82%]が微血で66%[63-68%]が梗塞であった。
英訳は同等の結果を得た。
マイクロブリードでは92% [90-93%) , 梗塞では81% [77-85%) を, 構造的類似性に基づく選択により達成した。
結論: LLaMA 3.1は、オランダの神経放射線学レポートからデータを抽出する強力な可能性を示している。
少ないショットプロンプトは数値変数のパフォーマンスを向上させるが、位置固有の変数には課題が残る。
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