論文の概要: Pre-AF 13: An Interpretable Atrial Fibrillation Risk Score Mined from Discharge Reports
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2606.10725v2
- Date: Wed, 10 Jun 2026 06:02:35 GMT
- ステータス: 翻訳完了
- システム内更新日: 2026-06-11 14:23:44.391556
- Title: Pre-AF 13: An Interpretable Atrial Fibrillation Risk Score Mined from Discharge Reports
- Title(参考訳): Pre-AF 13: 放電報告から推測できる心房細動リスクスコア
- Authors: Olga Shakhmatova, Dmitrii Kriukov, Daniil Larionov, Nikita Khromov, Iaroslav Bespalov, Alexander Zolotarev, Kirill Grishchenkov, Ekaterina Ivanova, Miron Kuznetsov, Ilya Sochenkov, Elizaveta Panchenko, Artem Shelmanov, Dmitry V. Dylov,
- Abstract要約: 心房細動 (AF) は心臓不整脈で最も多く、予後の決定因子である。
CVD患者のAFリスクを24カ月間予測する解釈可能なMLモデルを構築した。
45,000人の患者の80,576件の記録のうち、17,562件が包括的基準を満たし、1,438件(8.19%)がAFを開発した。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 35.15225826613469
- License: http://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
- Abstract: Background. Atrial fibrillation (AF) is the most prevalent cardiac arrhythmia and a major determinant of prognosis. Established AF risk scores rely on factors (older age, hypertension) nearly ubiquitous among patients with cardiovascular disease (CVD), offering limited stratification in this high-risk group. Most target long-term (5-10 year) rather than medium-term prediction. We developed interpretable ML models predicting AF risk over a 24-month and entire follow-up horizon in CVD patients using routinely collected hospital data. Methods. Single-center retrospective study of electronic health records from the National Research Cardiology Center (Russia) for patients aged >=18 with CVD but without pre-existing AF, hospitalized more than once between January 2012 and May 2019. A custom NLP pipeline transformed unstructured discharge reports into 73 structured features, combining a rule-based parser with transformer-based NER. Using LightAutoML we built a full model (73 features), a simple model (reduced subset), and a linear model for a bedside risk score. Performance was assessed by ROC AUC, compared with CHARGE-AF, C2HEST, MHS, and HAVOC, and interpreted via SHAP. Results. Of 80,576 records from 45,000 patients, 17,562 met inclusion criteria; 1,438 (8.19%) developed AF. The full model reached ROC AUC 0.735 (24-month) and 0.696 (entire follow-up); the simple model was nearly identical (0.725, 0.696). All non-linear models outperformed the four clinical risk scores (ROC AUC 0.53-0.64). The simple model uses 13 features and is named Pre-AF 13. SHAP identified age and left atrial volume as dominant predictors. A linear risk score (Pre-AF 9) stratified observed 24-month AF incidence from ~7% to 36%. Conclusion. Interpretable ML models built from routinely collected EHR data identify high-AF-risk CVD patients, outperforming established clinical risk scores.
- Abstract(参考訳): 背景。
心房細動 (AF) は心臓不整脈で最も多く、予後の決定因子である。
AFのリスクスコアは、心血管疾患(CVD)の患者でほぼどこでも見られる因子(高齢者、高血圧)に依存しており、このハイリスクグループでは限られた成層化を提供している。
ほとんどのターゲットは中期予測よりも長期(5~10年)である。
CVD患者に対して, 日常的に収集した病院データを用いて, 24カ月間, 術後24カ月間にAFリスクを予測できる解釈可能なMLモデルを構築した。
メソッド。
2012年1月から2019年5月までに1回以上入院したCVD患者18歳以上を対象に,国立研究心臓センター(ロシア)の電子健康記録を1施設で振り返って検討した。
カスタムのNLPパイプラインは、非構造化放電レポートを73の構造化特徴に変換し、ルールベースのパーサとトランスフォーマーベースのNERを組み合わせた。
LightAutoMLを使って、完全なモデル(73の機能)、シンプルなモデル(リデュースされたサブセット)、ベッドサイドのリスクスコアのための線形モデルを構築しました。
ROC AUCはCHARGE-AF, C2HEST, MHS, HAVOCと比較し, SHAPを用いて解析を行った。
結果。
45,000人の患者の80,576件の記録のうち、17,562件が包括的基準を満たし、1,438件(8.19%)がAFを開発した。
フルモデルがROC AUC 0.735 (24ヶ月) と 0.696 に到達し、単純なモデルはほぼ同じ (0.725, 0.696) となった。
すべての非線形モデルは4つの臨床リスクスコア(ROC AUC 0.53-0.64)を上回った。
単純なモデルでは13の機能が使われており、Pre-AF 13と命名されている。
SHAPは、年齢と左心房容積を支配的な予測因子として同定した。
線形リスクスコア (Pre-AF 9) は24カ月のAFの発生率を7%から36%に分類した。
結論。
EHRデータから構築された解釈可能なMLモデルは、高AFリスクのCVD患者を同定し、確立された臨床リスクスコアを上回った。
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