論文の概要: From Patches to Patients: A study of the tile-to-slide performance transferability in Digital Pathology
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2606.10778v1
- Date: Tue, 09 Jun 2026 12:33:14 GMT
- ステータス: 翻訳完了
- システム内更新日: 2026-06-10 15:40:58.49091
- Title: From Patches to Patients: A study of the tile-to-slide performance transferability in Digital Pathology
- Title(参考訳): パッチから患者へ:デジタル病理におけるタイル・スライディング性能伝達性に関する研究
- Authors: Sofiène Boutaj, Leo Fillioux, Maria Vakalopoulou, Stergios Christodoulidis, Pierre Marza,
- Abstract要約: 本研究では,効率的なタイルレベルの線形探索がスライドレベルの性能向上のための信頼性の高いプロキシとして機能するかどうかを考察する。
42のスライドレベルと16のタイルレベルのタスクに対して、19の最先端FMをベンチマークする。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 5.356949046416353
- License: http://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
- Abstract: Foundation Models (FMs) have recently redefined the state-of-the-art in histopathology by providing robust representations for whole-slide image (WSI) analysis. However, selecting the optimal foundation model (FM) for a specific clinical cohort currently requires multiple preprocessing steps, followed by computationally expensive feature extraction and the training of a Multiple Instance Learning (MIL) aggregator for every model. In this work, we investigate whether efficient tile-level linear probing can serve as a reliable proxy for slide-level performance, reducing the need to run full slide-level pipelines for every candidate encoder. We benchmark 19 state-of-the-art FMs on 42 slide-level and 16 tile-level tasks, comparing tile probing metrics against slide-level outcomes using ABMIL and Mean Pooling aggregations. We observe a high correlation between tile and slide performance across varying task difficulties, indicating that encoder representation quality is the primary determinant of WSI success. Sensitivity analyses show that transferability is stable across models and is more influenced by cohort sizes and numbers of tiles per slide than by average task difficulty. We also measure the agreement in best performing models between tile and slide-level tasks, showing tile benchmarks reliably shortlist strong candidates. Overall, our study indicates that tile-level benchmarking provides an efficient and practical first step for narrowing down candidate models, while slide-level evaluation remains essential for final validation on clinical tasks.
- Abstract(参考訳): ファンデーションモデル(FM)は、最近、全スライディング画像(WSI)解析のための堅牢な表現を提供することにより、病理学における最先端の状態を再定義した。
しかし、現在、特定の臨床コホートに対して最適な基礎モデル(FM)を選択するには、複数の前処理ステップが必要であり、計算にコストがかかる特徴抽出と、各モデルに対するMIL(Multiple Instance Learning)アグリゲータのトレーニングが続く。
本研究では,効率的なタイルレベル線形探索がスライドレベル性能の信頼できるプロキシとして機能するかどうかを検証し,各候補エンコーダに対して完全なスライドレベルパイプラインを実行する必要性を低減させる。
我々は,42のスライドレベルと16のタイルレベルのタスクに対して,19の最先端FMをベンチマークし,AMMILと平均プールアグリゲーションを用いて,タイル探索の指標とスライドレベルの結果を比較した。
本稿では,WSI の成功の主要因はエンコーダの表現品質であることを示すため,様々なタスクの難易度にまたがるタイルとスライド性能の相関性が高いことを示す。
感度分析により, 移動性はモデル間で安定であり, 平均作業困難度よりも, コホートサイズやスライドあたりのタイル数の影響が強いことが示された。
また、タイルレベルタスクとスライドレベルタスクの最良の実行モデルにおける合意を計測し、タイルベンチマークが確実に強力な候補をリストアップすることを示す。
概して, タイルレベルのベンチマークは, 候補モデルを絞り込むための効率的かつ実用的な第一歩であり, 臨床上の最終検証にはスライドレベルの評価が不可欠であることが示唆された。
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