論文の概要: MARD: Mirror-Augmented Reasoning Distillation for Mechanism-Level Drug-Drug Interaction Prediction
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2606.12578v1
- Date: Wed, 10 Jun 2026 18:26:11 GMT
- ステータス: 翻訳完了
- システム内更新日: 2026-06-12 15:55:27.402467
- Title: MARD: Mirror-Augmented Reasoning Distillation for Mechanism-Level Drug-Drug Interaction Prediction
- Title(参考訳): MARD : メカニズムレベル薬物と薬物の相互作用予測のためのミラー強化共鳴蒸留法
- Authors: Mohammadreza Riyazat, Vian Lelo, Rameen Jafri, Yumna Khan, Abeer Badawi,
- Abstract要約: メカニズムレベルの薬物・薬物相互作用(DDI)予測は、どの酵素または薬物動態軸が関与しているかを特定する必要がある。
そこで本研究では, 7- Family/147-subtype taxonomy を組み込んだ再現可能な機構レベルのDDIラベリングと評価プロトコルを提案する。
我々は、7B推論MARD(Mirror-Augmented Reasoning Distillation)を生成するパイプラインを提案する。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 0.0
- License: http://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
- Abstract: Mechanism-level drug-drug interaction (DDI) prediction requires identifying which enzyme or pharmacodynamic axis is implicated, in which direction, and with which evidence -- not merely whether two drugs interact. We introduce a reproducible mechanism-level DDI labelling and evaluation protocol with a structured 7-family/147-subtype taxonomy, leakage-safe cold-split protocols, and auditable reasoning metrics for evaluating pharmacological prediction beyond flat interaction classification. We propose a pipeline that produces a 7B reasoning MARD (Mirror-Augmented Reasoning Distillation), combining three training innovations: a single-token KL divergence on direction tag that ties the model's prediction, per-loss PRM-weighted DPO with programmatic hard negatives, and a leakage-safe mechanism-aware retrieval channel. Process-reward step labels are automatically verifiable against DrugBank-structured fields, requiring no human or LLM judges. On the April-2026 DrugBank release, our MARD-7B is the only system in a 32-system comparison whose accuracy survives drug-pair novelty, beating the best baseline by +13.9 pp and GPT-4o by +6.7 pp at ~1% of frontier API cost. Further analysis reveals an anti-memorisation signature where accuracy improves on rarely seen drugs, suggesting that gain comes from structured pharmacological reasoning rather than drug-frequency memorisation. We release corpus, DDI-PRM, retrieval index, and training code.
- Abstract(参考訳): メカニズムレベルの薬物と薬物の相互作用(DDI)予測では、どちらの酵素や薬物の軸がどの方向、どのエビデンスに関係しているかを特定する必要がある。
本研究では,7- Family/147-subtype 分類,リークセーフコールドスプリットプロトコル,および平らな相互作用分類を超えて薬理学的予測を評価するための監査可能な推論指標を用いた再現可能な機構レベルのDDIラベル付けおよび評価プロトコルを提案する。
本稿では、7B推論MARD(Mirror-Augmented Reasoning Distillation)を生成するパイプラインを提案し、モデルの予測に結びつく方向タグの単一トークンKL分散、プログラム的ハードネガ付きPRM重み付きDPO、漏洩安全機構対応検索チャネルの3つのトレーニングイノベーションを組み合わせた。
プロセス・リワード・ステップ・ラベルは、人やLLMの審査員を必要とせず、TarmBankの構造化されたフィールドに対して自動的に検証される。
4~2026年のDarmBankリリースでは、MARD-7Bが32システム比較で唯一のシステムであり、その正確さは薬のペアノベルティに留まり、最良ベースラインは+13.9pp、GPT-4oは+6.7pp、フロンティアAPIコストは+1%である。
さらに分析した結果、滅多に見られない薬物の精度が向上する反覚醒のサインが明らかとなり、薬剤の覚醒ではなく、構造化された薬理学的推論から得られることが示唆された。
コーパス、DDI-PRM、検索インデックス、トレーニングコードをリリースする。
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