論文の概要: NoLimits.jl: Flexible and Composable Nonlinear Mixed-Effects Modeling in Julia
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2606.24427v1
- Date: Tue, 23 Jun 2026 11:04:55 GMT
- ステータス: 翻訳完了
- システム内更新日: 2026-06-24 22:16:48.907562
- Title: NoLimits.jl: Flexible and Composable Nonlinear Mixed-Effects Modeling in Julia
- Title(参考訳): NoLimits.jl: Juliaにおけるフレキシブルで構成可能な非線形混合効果モデリング
- Authors: Manuel Huth, Jonas Arruda, Nina Schmid, Roy Gusinow, Vincent Wieland, Clemens Peiter, Jan Hasenauer,
- Abstract要約: NoLimits.jlは、フレキシブルで構成可能な非線形混合効果モデリングのためのオープンソースのJuliaパッケージである。
NoLimits.jlは、フレキシブルで、共依存的な観察とランダムな効果の分布をサポートする。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 1.4053129774629074
- License: http://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
- Abstract: Nonlinear mixed-effects models are widely used to analyze longitudinal data, but existing open-source software often supports only a limited subset of the model structures, inference methods, machine-learning components, automatic differentiation techniques, and random-effects distributions required in modern applications. We introduce NoLimits.jl, an open-source Julia package for flexible and composable nonlinear mixed-effects modeling. Its macro-based modeling language enables observation and latent-state models to be constructed from diverse building blocks, including ordinary differential equations, Markov models, and neural networks. NoLimits.jl supports flexible, covariate-dependent observation and random-effects distributions and provides a unified interface to frequentist inference through Laplace approximation, stochastic expectation maximization, and Bayesian Markov chain Monte Carlo methods. We demonstrate the package on three case studies showcasing its workflows, integration of differentiable machine-learning components, and data-driven estimation of random-effects distributions using normalizing flows. Together, these capabilities substantially expand the range of nonlinear mixed-effects models that can be specified, estimated, and compared within a single open-source framework.
- Abstract(参考訳): 非線形混合効果モデルは長手データの解析に広く用いられているが、既存のオープンソースソフトウェアはモデル構造、推論方法、機械学習コンポーネント、自動微分技術、そして現代のアプリケーションで必要とされるランダム影響分布の限られたサブセットしかサポートしていない。
我々は、フレキシブルで構成可能な非線形混合効果モデリングのためのオープンソースのJuliaパッケージであるNoLimits.jlを紹介した。
マクロベースのモデリング言語は、通常の微分方程式、マルコフモデル、ニューラルネットワークなど、様々な構造ブロックから観測および潜在状態モデルを構築することができる。
NoLimits.jl はフレキシブルで共変量に依存した観測とランダム効果の分布をサポートし、ラプラス近似、確率的予想最大化、ベイズマルコフ連鎖モンテカルロ法による頻繁な推論に統一的なインターフェースを提供する。
本パッケージは,そのワークフローを示す3つのケーススタディ,微分可能な機械学習コンポーネントの統合,正規化フローを用いたランダム・エフェクト分布のデータ駆動推定を実演する。
これらの能力は、単一のオープンソースフレームワーク内で特定、推定、比較できる非線形混合効果モデルの範囲を大幅に拡大する。
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