論文の概要: Reduction of Probabilistic Chemical Reaction Networks
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2606.27737v1
- Date: Fri, 26 Jun 2026 05:36:32 GMT
- ステータス: 翻訳完了
- システム内更新日: 2026-06-29 18:24:25.375778
- Title: Reduction of Probabilistic Chemical Reaction Networks
- Title(参考訳): 確率化学反応ネットワークの低減
- Authors: Mauricio Montes, Gregoire Sergeant-Perthuis,
- Abstract要約: 化学反応ネットワークは細胞レベルで適応的な振る舞いをプログラムするためにどのように使用できるかを示す。
Napp-Adams-Compiled CRNで符号化された因子グラフ構造を復元することにより、最近の因子グラフ削減結果をそれらの化学実装に転送する。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 0.0
- License: http://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
- Abstract: Programming adaptive behaviors at the cellular level is a long-standing goal that raises the question of how probabilistic computation can be implemented in biochemical systems. Chemical reaction networks (CRNs) provide such a substrate and have been shown to realize probabilistic models, including hidden Markov models and factor graphs, with dynamics reproducing Bayesian inference and belief propagation. However, encoding these algorithms typically requires prohibitively large reaction networks, and classical CRN reduction techniques do not directly apply. By recovering the factor graph structure encoded in Napp--Adams-compiled CRNs, we transport recent factor-graph reduction results to their chemical implementations, obtaining significantly smaller CRNs while preserving the belief-propagation fixed points on surviving variables.
- Abstract(参考訳): 細胞レベルで適応的な振る舞いをプログラミングすることは、生物化学システムにおいて確率論的計算をどのように実装できるかという疑問を提起する長年の目標である。
化学反応ネットワーク(CRN)はそのような基質を提供し、隠れマルコフモデルや因子グラフを含む確率的モデルを実現し、ベイズ的推論と信念の伝播を動的に再現している。
しかしながら、これらのアルゴリズムの符号化は通常、違法に大規模な反応ネットワークを必要とするが、古典的なCRN還元技術は直接適用されない。
Napp-Adams-Compiled CRN に符号化された因子グラフ構造を復元することにより,最近の因子グラフ削減結果をそれらの化学実装に伝達し,生き残った変数の信念伝播固定点を保ちながらCRNを著しく小さくする。
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