論文の概要: A Transferable Learned Temporal Prior for Transmission Reconstruction and Decision-Relevant Uncertainty in Real Outbreak Labels

• arxiv url: http://arxiv.org/abs/2606.30842v1
• Date: Mon, 29 Jun 2026 19:19:52 GMT
• ステータス: 翻訳完了
• システム内更新日: 2026-07-01 18:27:18.991818
• Title: A Transferable Learned Temporal Prior for Transmission Reconstruction and Decision-Relevant Uncertainty in Real Outbreak Labels
• Title（参考訳）: 実アウトブレイクラベルにおけるトランスミッション再構成と決定関連不確かさの事前学習
• Abstract要約: アウトブレイクトランスミッションは疫学的タイミングと送信ラベルを決定論的基底真理として扱うが、どちらも体系的に評価されていない。 対象の発症データにアクセスする前に,11家族を対象に,ロジスティック・レグレッション・タイムをトレーニングし,全パラメータをロックし,厳格なアンデスウイルス(ANDV)による29タスクのベンチマークに適合させることなく適用した。 ロックされた平均相反ランク (MRR) 0.571対0.274とTop-1の精度37.9%対13.8%対最高のソーストレーニングされたパラメトリックベースラインである。
• 参考スコア（独自算出の注目度）: 0.0
• License: http://arxiv.org/licenses/nonexclusive-distrib/1.0/
• Abstract: Outbreak transmission reconstruction treats epidemiological timing and transmission labels as deterministic ground truth; neither has been systematically evaluated. We trained a logistic regression temporal prior on eleven disease families, locked all parameters before accessing any target outbreak data, and applied it without refitting to a strict Andes virus (ANDV) parent-ranking benchmark of 29 tasks. The locked prior achieved mean reciprocal rank (MRR) 0.571 versus 0.274 and Top-1 accuracy 37.9% versus 13.8% against the best source-trained parametric baseline (permutation p <= 0.0002; 7-8 reversals to lose MRR significance). A phylogenetic concordance audit of 75 NYC mpox inter-host pairs - independent label-reliability evidence rather than a prior validation - found that 54.67% (exact 95% CI: 42.75-66.21%) were genomically unresolved or unsupported. Retaining uncertain edges in ANDV and Guangdong Delta graphs shifted top-5 source-priority sets (Jaccard 0.429-0.667). Transmission-label uncertainty was measurable in the outbreak evidence modules examined, and retaining uncertain links changed which source cases were prioritized for intervention.
• Abstract（参考訳）: アウトブレイクトランスミッションは疫学的タイミングと送信ラベルを決定論的基底真理として扱うが、どちらも体系的に評価されていない。 対象の発症データにアクセスする前に,11家族を対象に,ロジスティック・レグレッション・タイムをトレーニングし,全パラメータをロックし,厳格なアンデスウイルス(ANDV)による29タスクのベンチマークに適合させることなく適用した。 ロック前の平均逆位 (MRR) 0.571 対 0.274 対 トップ-1 の精度は37.9% 対 13.8% 対 最高のソーストレーニングされたパラメトリックベースライン (p <= 0.0002; 7-8 は MRR の重要性を失う) に対して達成された。 75のNYC mpox 対の系統的一致監査(事前の検証よりも独立したラベルと信頼性の証拠)により、54.67%(95% CI: 42.75-66.21%)がゲノム的に未解決または未解決であることが判明した。 ANDV と Guangdong Delta グラフにおける不確実なエッジを保持することは、トップ5のソースプライオリティセット(Jaccard 0.429-0.667)をシフトさせた。 アウトブレイクエビデンスモジュールでは伝送ラベルの不確かさが測定可能であり,どの事例を介入に優先するかが不確実なリンクを保ったままであった。

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