論文の概要: GlaKG: A Biomarker-Centric Fundus Knowledge Graph for Explainable Glaucoma Diagnosis and Risk Assessment
- arxiv url: http://arxiv.org/abs/2607.04673v1
- Date: Mon, 06 Jul 2026 04:56:39 GMT
- ステータス: 翻訳完了
- システム内更新日: 2026-07-07 22:26:30.041738
- Title: GlaKG: A Biomarker-Centric Fundus Knowledge Graph for Explainable Glaucoma Diagnosis and Risk Assessment
- Title(参考訳): GlaKG: 説明可能な緑内障診断とリスクアセスメントのためのバイオマーカー中心の知識グラフ
- Abstract要約: 緑内障診断とリスク階層化のためのバイオマーカー中心の基礎知識グラフであるGlaKGについて述べる。
あらゆる予測には、バイオマーカーの証拠を活性化された臨床規則に結びつける明確な推論連鎖が伴う。
GlaKG は二型緑内障分類では F1 = 0.9953 、四級リスク層化では 0.922 重み付き F1 の精度 0.930 に達する。
- 参考スコア(独自算出の注目度): 17.43192330071824
- License: http://creativecommons.org/licenses/by/4.0/
- Abstract: Glaucoma is a leading cause of irreversible blindness worldwide, yet most automated diagnosis systems rely on opaque deep-learning models that offer little clinical interpretability. We present GlaKG, a biomarker-centric fundus knowledge graph that integrates structural biomarkers, clinically grounded rules, and image features to produce traceable reasoning for glaucoma diagnosis and risk stratification. GlaKG encodes six entity types (Fundus Image, Optic Disc, Neural Rim, Pathology, Diagnosis, Risk Level), eight relation types, and 11 clinically validated rules into a unified graph, so that every prediction is accompanied by an explicit reasoning chain linking biomarker evidence to activated clinical rules. To keep knowledge-based reasoning strictly separate from label information, we adopt a post-processing fusion framework that combines ResNet50 image embeddings with a normalized KG reasoning-chain score via a tunable weight alpha, with all fitting confined to the training split. On a publicly available, AI-annotated fundus dataset, GlaKG reaches F1 = 0.9953 for binary glaucoma classification and 0.930 accuracy with 0.922 weighted F1 for four-class risk stratification; we report openly that the dataset's biomarker annotations are highly label-correlated, and therefore frame these figures as an upper bound attainable with clean structured biomarkers rather than as leakage-free image-only performance. Feature-importance analysis shows KG-derived and biomarker features contributing near-equally (51.1% vs. 48.9%), and the reasoning chain flags borderline cases by exposing low chain scores rather than failing silently. GlaKG's central contribution is therefore a clinically auditable reasoning framework that complements raw predictive performance by explicitly exposing the biomarker evidence and rule activations behind each decision.
- Abstract(参考訳): 緑内障は世界中で不可逆的な失明の原因となっているが、ほとんどの自動診断システムは、臨床的にはほとんど解釈できない不透明なディープラーニングモデルに依存している。
バイオマーカー中心の基盤知識グラフであるGlaKGについて述べる。GlaKGは構造的バイオマーカー、臨床的根拠を持つルール、画像特徴を統合して、緑内障の診断とリスク階層化のためのトレース可能な推論を生成する。
GlaKGは、6つのエンティティタイプ(Fundus Image, Optic Disc, Neural Rim, Pathology, Diagnosis, Risk Level)、8つの関係タイプ、11の臨床的に検証されたルールを統一されたグラフにエンコードしている。
ラベル情報から知識に基づく推論を厳密に分離するために,ResNet50イメージ埋め込みと正規化KG推論チェーンスコアを調整可能なウェイトアルファを用いて組み合わせた後処理融合フレームワークを採用し,トレーニング分割に限定した。
一般に公開されているAIアノテート・ファンドス・データセットにおいて、GlaKGは二値緑内障分類ではF1 = 0.9953、四値リスク階層化では0.922の重み付きF1で0.930の精度に達する。
特徴重要度分析は、KG由来およびバイオマーカーの特徴がほぼ等しい(51.1% vs. 48.9%)ことを示し、推論連鎖は、無声で失敗するよりも、低い連鎖スコアを露出することによって境界線のケースを識別する。
したがって、GlaKGの中心的な貢献は、生の予測性能を補完する臨床的に監査可能な推論フレームワークであり、それぞれの決定の背後にあるバイオマーカーのエビデンスとルールアクティベーションを明示的に露呈する。
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